58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7745 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  832    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  36.08 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  34.73 
 
 		 855 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  50.4 
 
 		 854 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  33.46 
 
 		 852 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 		 848 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  30.18 
 
 		 843 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  33.92 
 
 		 822 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  31.46 
 
 		 842 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 		 822 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  41.46 
 
 		 807 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 		 855 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  30.3 
 
 		 838 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  39.33 
 
 		 828 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  31.72 
 
 		 874 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 		 838 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  31.85 
 
 		 863 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  39.39 
 
 		 867 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.09 
 
 		 845 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  30.6 
 
 		 834 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  34.15 
 
 		 821 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.63 
 
 		 841 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  30.48 
 
 		 823 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  40.35 
 
 		 627 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  35.32 
 
 		 839 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  32.56 
 
 		 648 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  38.1 
 
 		 640 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  32.17 
 
 		 849 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  42.86 
 
 		 855 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  34.01 
 
 		 852 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  35.66 
 
 		 643 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 		 856 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  26.74 
 
 		 858 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 		 853 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  31.89 
 
 		 854 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  37.17 
 
 		 841 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 897 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  26.71 
 
 		 857 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  34.13 
 
 		 880 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 		 878 aa  47.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  33.86 
 
 		 857 aa  47  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  26.92 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 861 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.56 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0320  hypothetical protein  30.16 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.895075  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 		 853 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 638 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.34 
 
 		 873 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.7 
 
 		 835 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0680  ABC transporter permease protein  31.03 
 
 		 640 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00920993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  37.88 
 
 		 838 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  27.78 
 
 		 868 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 833 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  33.53 
 
 		 822 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  29.33 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 703 aa  43.1  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  30.95 
 
 		 871 aa  43.1  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>