More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0529 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1578    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  32.05 
 
 		 854 aa  232  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 		 855 aa  216  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  30.43 
 
 		 863 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  37.23 
 
 		 852 aa  197  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  32.2 
 
 		 807 aa  190  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  29.43 
 
 		 852 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 		 828 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  33.18 
 
 		 867 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  30.61 
 
 		 822 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  35.58 
 
 		 638 aa  156  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  31.67 
 
 		 822 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.97 
 
 		 848 aa  145  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  33.39 
 
 		 643 aa  139  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  28.44 
 
 		 838 aa  128  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.46 
 
 		 845 aa  128  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 834 aa  127  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  31.27 
 
 		 823 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  27.26 
 
 		 873 aa  122  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 		 859 aa  121  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 		 852 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  31.99 
 
 		 838 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 		 853 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.31 
 
 		 855 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.07 
 
 		 843 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.24 
 
 		 842 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  27.41 
 
 		 861 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  28.39 
 
 		 825 aa  101  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.55 
 
 		 849 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27 
 
 		 847 aa  99.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 838 aa  97.8  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  27.27 
 
 		 849 aa  97.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  30.11 
 
 		 841 aa  96.3  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  26.49 
 
 		 854 aa  94  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.29 
 
 		 857 aa  93.2  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 		 856 aa  91.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.43 
 
 		 821 aa  89.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.87 
 
 		 858 aa  88.2  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.04 
 
 		 836 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 839 aa  83.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.78 
 
 		 835 aa  82.8  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 		 648 aa  82.8  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 		 897 aa  80.5  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  25.48 
 
 		 853 aa  77.4  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26 
 
 		 880 aa  76.6  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 866 aa  75.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 		 861 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  35.33 
 
 		 850 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  30.36 
 
 		 874 aa  75.1  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 806 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.92 
 
 		 855 aa  73.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  32.97 
 
 		 851 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.67 
 
 		 849 aa  71.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.85 
 
 		 640 aa  66.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 		 822 aa  65.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  32.87 
 
 		 846 aa  64.7  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.21 
 
 		 856 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  37.61 
 
 		 873 aa  64.7  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 		 930 aa  63.9  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  31.26 
 
 		 627 aa  64.3  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  30.04 
 
 		 850 aa  62  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 		 801 aa  61.6  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27.89 
 
 		 855 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.45 
 
 		 870 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  29.7 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  27.53 
 
 		 828 aa  59.3  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  26.36 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  34.27 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.8 
 
 		 816 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  27.33 
 
 		 833 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 		 846 aa  57  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.08 
 
 		 419 aa  56.6  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  31.85 
 
 		 849 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  34.16 
 
 		 849 aa  56.6  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2587  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 		 445 aa  55.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.110239  normal  0.0409954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 		 635 aa  55.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4553  ABC transporter, permease protein  24.43 
 
 		 637 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388232  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  30.91 
 
 		 386 aa  55.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  34.27 
 
 		 926 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.06 
 
 		 640 aa  54.7  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.71 
 
 		 859 aa  54.3  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.85 
 
 		 656 aa  54.3  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4332  ABC transporter permease  25.38 
 
 		 638 aa  54.3  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4667  ABC transporter permease  25.38 
 
 		 638 aa  54.3  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0681  ABC transporter, permease protein  24.43 
 
 		 636 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.003357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  29.38 
 
 		 648 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4180  ABC transporter, permease  25.38 
 
 		 638 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.35 
 
 		 809 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  38.46 
 
 		 394 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  29.38 
 
 		 648 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  28.65 
 
 		 397 aa  53.9  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  34.09 
 
 		 647 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  35.61 
 
 		 857 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  33.51 
 
 		 401 aa  53.5  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  34.15 
 
 		 397 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.05 
 
 		 871 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  32.77 
 
 		 780 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 837 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0489  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  32.59 
 
 		 420 aa  52.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>