More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2825 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
855 aa  1593    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  43.19 
 
 
859 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  43.07 
 
 
871 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  38.16 
 
 
878 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  40.97 
 
 
857 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  40.18 
 
 
846 aa  369  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  33.63 
 
 
880 aa  337  7e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  39.22 
 
 
846 aa  328  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 
897 aa  296  8e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  36.48 
 
 
835 aa  294  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  37.76 
 
 
836 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  35.02 
 
 
841 aa  265  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  35.16 
 
 
825 aa  263  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  30.54 
 
 
855 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  36.31 
 
 
839 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  30.31 
 
 
842 aa  231  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  36.7 
 
 
848 aa  230  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  39.29 
 
 
738 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.71 
 
 
838 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 
856 aa  224  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  31.85 
 
 
852 aa  217  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  32.67 
 
 
843 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  33.46 
 
 
845 aa  211  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
861 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  33.76 
 
 
853 aa  199  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  32.45 
 
 
847 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
859 aa  190  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  34.72 
 
 
828 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  28.56 
 
 
853 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  31.19 
 
 
821 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 
930 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  28.52 
 
 
854 aa  174  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  31.44 
 
 
861 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  34.54 
 
 
873 aa  167  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  36.53 
 
 
826 aa  163  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 
873 aa  162  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  31.09 
 
 
853 aa  151  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  30.53 
 
 
855 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  37.2 
 
 
857 aa  134  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  32.5 
 
 
866 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.66 
 
 
857 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.21 
 
 
858 aa  125  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  31.05 
 
 
822 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  20.5 
 
 
833 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  47.11 
 
 
849 aa  95.9  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27.17 
 
 
858 aa  95.5  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  27.85 
 
 
854 aa  94  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.71 
 
 
849 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.84 
 
 
863 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  46.28 
 
 
849 aa  92  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.7 
 
 
850 aa  89.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 
409 aa  89.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 
855 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.85 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 
822 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  32.79 
 
 
488 aa  82  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  40.82 
 
 
834 aa  82.4  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  19.72 
 
 
794 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26.27 
 
 
857 aa  80.9  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  32.19 
 
 
806 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  20.23 
 
 
850 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.08 
 
 
870 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 
837 aa  77  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.19 
 
 
851 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27.24 
 
 
846 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  33.18 
 
 
801 aa  76.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  30.41 
 
 
852 aa  75.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.16 
 
 
866 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  28.86 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 
775 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.98 
 
 
855 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  24.52 
 
 
896 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 
857 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  22.06 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  40.85 
 
 
877 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.13 
 
 
856 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  28.99 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 
792 aa  70.5  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 
849 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  25.49 
 
 
649 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 
822 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  23.64 
 
 
408 aa  70.1  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  28.36 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.6 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  27.46 
 
 
648 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.79 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  27.46 
 
 
648 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  26.06 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  40.37 
 
 
877 aa  67.4  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  34.78 
 
 
867 aa  67.4  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  36.24 
 
 
884 aa  67.4  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 
852 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  28.75 
 
 
402 aa  66.6  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.9 
 
 
641 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  27.07 
 
 
841 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  20.19 
 
 
395 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  31.77 
 
 
397 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>