More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1858 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  88.68 
 
 		 866 aa  1397    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  100 
 
 		 870 aa  1686    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  48.1 
 
 		 850 aa  741    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  51.33 
 
 		 849 aa  803    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  45.09 
 
 		 847 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  44.86 
 
 		 847 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  56.86 
 
 		 845 aa  773    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  48.31 
 
 		 839 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  42.82 
 
 		 855 aa  622  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  46.79 
 
 		 837 aa  515  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  45.06 
 
 		 843 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  44.47 
 
 		 843 aa  489  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  38.43 
 
 		 846 aa  342  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  35.3 
 
 		 841 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  29.31 
 
 		 858 aa  307  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  35.18 
 
 		 842 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  33.46 
 
 		 842 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  33.46 
 
 		 842 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  29.04 
 
 		 851 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  29.68 
 
 		 850 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 		 849 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 		 849 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27.43 
 
 		 858 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  28.09 
 
 		 855 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  30.13 
 
 		 855 aa  224  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  26.91 
 
 		 879 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  26.7 
 
 		 889 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.92 
 
 		 817 aa  217  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 884 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 		 857 aa  212  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.36 
 
 		 820 aa  210  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  25.49 
 
 		 817 aa  210  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  26.5 
 
 		 889 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 		 821 aa  208  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27.29 
 
 		 846 aa  207  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  27.25 
 
 		 878 aa  205  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  25.2 
 
 		 817 aa  204  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28.19 
 
 		 819 aa  204  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  28.91 
 
 		 844 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  30.43 
 
 		 821 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 		 835 aa  195  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 		 835 aa  195  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  25.92 
 
 		 836 aa  195  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  26.49 
 
 		 897 aa  194  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  26.16 
 
 		 840 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  24.66 
 
 		 865 aa  191  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  28.03 
 
 		 857 aa  191  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  27 
 
 		 887 aa  189  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 877 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  27.12 
 
 		 887 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  27.97 
 
 		 866 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 		 884 aa  184  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  28.78 
 
 		 877 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  27.05 
 
 		 815 aa  183  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  27.41 
 
 		 889 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.26 
 
 		 867 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  27.45 
 
 		 825 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  25.71 
 
 		 845 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  26.25 
 
 		 849 aa  172  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  25.31 
 
 		 850 aa  171  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  27.05 
 
 		 819 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.82 
 
 		 855 aa  170  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  27.1 
 
 		 821 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.16 
 
 		 800 aa  168  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  27.15 
 
 		 819 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  26.22 
 
 		 868 aa  165  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.56 
 
 		 843 aa  159  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  28.22 
 
 		 793 aa  158  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 800 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  26.99 
 
 		 826 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  23.17 
 
 		 803 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 852 aa  147  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 		 856 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.94 
 
 		 842 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  29.19 
 
 		 802 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.83 
 
 		 848 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.38 
 
 		 847 aa  138  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  33.12 
 
 		 804 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.63 
 
 		 836 aa  128  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.01 
 
 		 845 aa  126  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.45 
 
 		 825 aa  125  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  25.79 
 
 		 849 aa  125  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  28.4 
 
 		 795 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  29.83 
 
 		 872 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 		 859 aa  122  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 873 aa  120  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.35 
 
 		 841 aa  119  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 		 408 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 861 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  25.63 
 
 		 849 aa  118  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 		 834 aa  118  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  22.23 
 
 		 854 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.41 
 
 		 836 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  28.41 
 
 		 836 aa  114  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  28.65 
 
 		 820 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 		 853 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 		 853 aa  108  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  31.23 
 
 		 853 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  28.09 
 
 		 819 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  28.81 
 
 		 820 aa  101  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>