150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2027 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  57.23 
 
 		 819 aa  738    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  73.65 
 
 		 825 aa  1055    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  76.59 
 
 		 826 aa  1033    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  51.23 
 
 		 820 aa  685    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  100 
 
 		 815 aa  1600    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  52.39 
 
 		 821 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  52.64 
 
 		 821 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  51.78 
 
 		 821 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  52.21 
 
 		 819 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  51.23 
 
 		 820 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  57.34 
 
 		 819 aa  743    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  50.98 
 
 		 821 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  57.88 
 
 		 820 aa  743    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  55.28 
 
 		 819 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  43.79 
 
 		 800 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  48.41 
 
 		 800 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  45.19 
 
 		 802 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  44 
 
 		 793 aa  525  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  48.59 
 
 		 795 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  48.22 
 
 		 795 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  48.34 
 
 		 795 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  40.61 
 
 		 804 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  31.11 
 
 		 817 aa  331  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  30.32 
 
 		 817 aa  319  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.64 
 
 		 817 aa  310  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  30.7 
 
 		 836 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  31.29 
 
 		 849 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 		 884 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  30.22 
 
 		 889 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  32.24 
 
 		 850 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  29.69 
 
 		 889 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  28.71 
 
 		 865 aa  261  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  29.36 
 
 		 840 aa  259  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  29.75 
 
 		 879 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  29.49 
 
 		 836 aa  257  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.37 
 
 		 836 aa  257  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  30.28 
 
 		 887 aa  250  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  29.79 
 
 		 887 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  30.16 
 
 		 889 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.74 
 
 		 897 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  28.87 
 
 		 878 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.96 
 
 		 850 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  29.7 
 
 		 845 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.25 
 
 		 849 aa  233  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 		 847 aa  213  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 847 aa  211  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  29.49 
 
 		 872 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 		 839 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.63 
 
 		 870 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.91 
 
 		 855 aa  195  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.34 
 
 		 845 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  26.49 
 
 		 803 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.77 
 
 		 866 aa  179  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 		 837 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  27.63 
 
 		 753 aa  160  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  24.28 
 
 		 813 aa  158  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.28 
 
 		 843 aa  146  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.45 
 
 		 858 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  31.15 
 
 		 846 aa  125  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.27 
 
 		 855 aa  124  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  27.69 
 
 		 841 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  29.74 
 
 		 843 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 		 884 aa  108  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  23.61 
 
 		 844 aa  107  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  23.47 
 
 		 858 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  24.3 
 
 		 857 aa  104  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  29.13 
 
 		 929 aa  101  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  22.22 
 
 		 846 aa  88.2  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  21.85 
 
 		 850 aa  87.8  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  22.64 
 
 		 851 aa  87  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  24.31 
 
 		 867 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  23.03 
 
 		 857 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 842 aa  77.8  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  25.24 
 
 		 877 aa  74.3  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 		 877 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  22.69 
 
 		 843 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  24.12 
 
 		 855 aa  63.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.83 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  24.83 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  22.18 
 
 		 845 aa  61.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  23.17 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 		 849 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  24.81 
 
 		 853 aa  58.9  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  22.82 
 
 		 841 aa  58.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  22.64 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 849 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  25.28 
 
 		 379 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2397  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  24.83 
 
 		 414 aa  55.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 		 379 aa  55.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  21.53 
 
 		 430 aa  53.9  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.91 
 
 		 399 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  21.96 
 
 		 797 aa  50.8  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.98 
 
 		 434 aa  50.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.02 
 
 		 842 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  23.48 
 
 		 416 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  24.54 
 
 		 416 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  23.77 
 
 		 426 aa  49.7  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 		 809 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 		 835 aa  49.3  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>