More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1658 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  100 
 
 		 850 aa  1677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  76.62 
 
 		 851 aa  1285    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  73.06 
 
 		 849 aa  1141    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  72.82 
 
 		 849 aa  1146    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  28.65 
 
 		 849 aa  287  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  29.68 
 
 		 870 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  29.43 
 
 		 866 aa  252  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.99 
 
 		 850 aa  244  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.35 
 
 		 855 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 		 847 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 845 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  26.09 
 
 		 858 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 847 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.2 
 
 		 855 aa  194  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 		 839 aa  191  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.85 
 
 		 843 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 837 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  27.86 
 
 		 841 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 		 844 aa  167  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.79 
 
 		 843 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 884 aa  159  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  29.72 
 
 		 845 aa  151  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  25.83 
 
 		 857 aa  151  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 877 aa  151  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 857 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.89 
 
 		 852 aa  149  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  26.82 
 
 		 867 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  25.78 
 
 		 846 aa  147  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  26.32 
 
 		 868 aa  145  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 856 aa  144  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  25.94 
 
 		 858 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.7 
 
 		 836 aa  142  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  25.89 
 
 		 877 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.42 
 
 		 842 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.83 
 
 		 847 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 		 848 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.13 
 
 		 854 aa  134  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.81 
 
 		 849 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.56 
 
 		 855 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 859 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 861 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 855 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  26.49 
 
 		 866 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  25.03 
 
 		 873 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  24.74 
 
 		 855 aa  126  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  26.66 
 
 		 835 aa  126  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  26.66 
 
 		 835 aa  126  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.48 
 
 		 841 aa  124  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  27.96 
 
 		 853 aa  124  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 839 aa  121  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 		 866 aa  121  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  25.49 
 
 		 821 aa  118  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.29 
 
 		 825 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  25.71 
 
 		 849 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 		 834 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 838 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  27.93 
 
 		 842 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 		 842 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 842 aa  97.8  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 		 871 aa  95.9  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 855 aa  95.5  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  25.9 
 
 		 861 aa  95.1  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.61 
 
 		 858 aa  93.6  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 806 aa  93.2  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  22.66 
 
 		 879 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.41 
 
 		 857 aa  92  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 857 aa  91.3  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  26.27 
 
 		 419 aa  90.5  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  21.07 
 
 		 865 aa  90.1  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 		 897 aa  89.4  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 930 aa  89  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  22.26 
 
 		 889 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 		 884 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  21.99 
 
 		 889 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 		 853 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.11 
 
 		 880 aa  86.7  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  30.42 
 
 		 843 aa  84.7  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 		 853 aa  84.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 821 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  23.35 
 
 		 878 aa  83.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.65 
 
 		 835 aa  84  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  18.49 
 
 		 856 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  29.27 
 
 		 827 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  21.19 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.19 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 846 aa  80.5  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 		 445 aa  80.1  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  24.51 
 
 		 775 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  23.22 
 
 		 863 aa  79  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  21.88 
 
 		 887 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.73 
 
 		 420 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.04 
 
 		 859 aa  76.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.08 
 
 		 855 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  22.87 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  20.46 
 
 		 817 aa  75.5  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  21.82 
 
 		 897 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  22.33 
 
 		 850 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  25.69 
 
 		 820 aa  74.7  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  22.45 
 
 		 887 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>