More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1312 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  100 
 
 
843 aa  1593    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  44.07 
 
 
849 aa  634  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  51.6 
 
 
843 aa  594  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  43.28 
 
 
850 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  44.68 
 
 
847 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  44.68 
 
 
847 aa  558  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  45.82 
 
 
839 aa  548  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  46.82 
 
 
845 aa  541  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  40.28 
 
 
855 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  45.06 
 
 
870 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  44.43 
 
 
866 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  46.81 
 
 
837 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  29.13 
 
 
851 aa  243  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  29.89 
 
 
858 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.76 
 
 
858 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  32.18 
 
 
846 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  30.53 
 
 
855 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  35.06 
 
 
841 aa  231  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
842 aa  230  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 
857 aa  228  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  34.82 
 
 
842 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  34.41 
 
 
842 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  33.29 
 
 
844 aa  225  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  28.42 
 
 
850 aa  217  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  31.46 
 
 
857 aa  210  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  29.69 
 
 
868 aa  207  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.14 
 
 
849 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 
821 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  31.7 
 
 
855 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 
849 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.86 
 
 
820 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  26.6 
 
 
817 aa  202  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  29.12 
 
 
819 aa  201  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  26.09 
 
 
817 aa  200  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  31.57 
 
 
853 aa  198  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  25.72 
 
 
836 aa  194  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  31.67 
 
 
877 aa  194  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  24.77 
 
 
865 aa  191  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 
884 aa  191  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.78 
 
 
817 aa  190  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  31.37 
 
 
877 aa  189  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 
835 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
835 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.35 
 
 
821 aa  177  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  29.56 
 
 
867 aa  177  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  27.05 
 
 
850 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  25.63 
 
 
845 aa  173  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 
800 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  29.21 
 
 
821 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  26.85 
 
 
889 aa  170  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  27.24 
 
 
879 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  42.07 
 
 
846 aa  168  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
884 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  26.69 
 
 
889 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.45 
 
 
855 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  30.1 
 
 
821 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  31.56 
 
 
825 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  31.41 
 
 
793 aa  154  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  22.65 
 
 
803 aa  154  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  26.22 
 
 
849 aa  153  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  25.96 
 
 
897 aa  153  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  26.7 
 
 
887 aa  152  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  26.93 
 
 
887 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  26.14 
 
 
878 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.34 
 
 
848 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  27.38 
 
 
889 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 
834 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 
861 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.23 
 
 
843 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.93 
 
 
842 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.79 
 
 
854 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  32.21 
 
 
820 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  33.15 
 
 
819 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  34.05 
 
 
804 aa  125  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
852 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.32 
 
 
845 aa  125  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  27 
 
 
836 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.5 
 
 
841 aa  122  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.45 
 
 
847 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  33.8 
 
 
826 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  32.77 
 
 
819 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  29.97 
 
 
838 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.72 
 
 
836 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  33.61 
 
 
819 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  32.49 
 
 
815 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  33.43 
 
 
800 aa  108  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 
408 aa  108  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  35.2 
 
 
445 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  29.86 
 
 
840 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  24.97 
 
 
849 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.9 
 
 
820 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  33.88 
 
 
795 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 
859 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.66 
 
 
821 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.4 
 
 
857 aa  99  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.6 
 
 
853 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 
855 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.27 
 
 
836 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 
856 aa  94.7  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 
855 aa  94.4  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>