More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1688 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 846 aa  1608    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  45.89 
 
 		 837 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  36.73 
 
 		 850 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  36.52 
 
 		 847 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  35.63 
 
 		 849 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  36.14 
 
 		 847 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  34.12 
 
 		 855 aa  392  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  37.47 
 
 		 839 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  38.43 
 
 		 870 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  38.07 
 
 		 845 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  37.54 
 
 		 866 aa  360  7e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  38.82 
 
 		 843 aa  326  9e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  38.73 
 
 		 843 aa  326  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.48 
 
 		 817 aa  242  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  27.34 
 
 		 817 aa  229  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  30.83 
 
 		 858 aa  224  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.58 
 
 		 858 aa  211  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  26.48 
 
 		 879 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  25.96 
 
 		 889 aa  204  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.83 
 
 		 820 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  32.53 
 
 		 842 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 884 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28.59 
 
 		 819 aa  195  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  26.18 
 
 		 889 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.93 
 
 		 857 aa  194  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 		 821 aa  194  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  26.67 
 
 		 855 aa  194  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  28.36 
 
 		 857 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  33.21 
 
 		 842 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.42 
 
 		 851 aa  191  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  25.66 
 
 		 817 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  26.33 
 
 		 878 aa  188  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  30.04 
 
 		 821 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  28.29 
 
 		 846 aa  187  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.82 
 
 		 841 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  32.93 
 
 		 842 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  26.23 
 
 		 887 aa  184  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  26.45 
 
 		 887 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  28.35 
 
 		 867 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.85 
 
 		 850 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  24.81 
 
 		 897 aa  178  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  28.43 
 
 		 821 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  24.04 
 
 		 865 aa  170  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  27.46 
 
 		 868 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 		 844 aa  162  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  26.6 
 
 		 850 aa  160  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 884 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  23.68 
 
 		 845 aa  153  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  27.16 
 
 		 800 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 		 835 aa  145  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 		 835 aa  145  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  22.58 
 
 		 803 aa  144  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  27.85 
 
 		 793 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  31.79 
 
 		 836 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  28.1 
 
 		 877 aa  139  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 		 877 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  27.68 
 
 		 855 aa  135  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  27.58 
 
 		 889 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  26.92 
 
 		 840 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  27.05 
 
 		 802 aa  124  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  21.05 
 
 		 813 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  32.43 
 
 		 408 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  27.71 
 
 		 836 aa  121  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  29.08 
 
 		 825 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.49 
 
 		 843 aa  119  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.16 
 
 		 836 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.08 
 
 		 849 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  30.79 
 
 		 853 aa  115  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  29.26 
 
 		 820 aa  114  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  33.23 
 
 		 800 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  29.71 
 
 		 804 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.95 
 
 		 849 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  30.91 
 
 		 815 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  24.48 
 
 		 929 aa  108  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.37 
 
 		 849 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.43 
 
 		 855 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  25.34 
 
 		 849 aa  105  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  31.09 
 
 		 819 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 852 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  28.74 
 
 		 753 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  33.85 
 
 		 445 aa  101  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  29.86 
 
 		 819 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.93 
 
 		 858 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.95 
 
 		 857 aa  99  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.06 
 
 		 841 aa  98.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  29.86 
 
 		 819 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 		 848 aa  97.8  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  30 
 
 		 826 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  31.64 
 
 		 820 aa  94.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 861 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  27.24 
 
 		 821 aa  94.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.23 
 
 		 842 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 		 838 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.19 
 
 		 845 aa  91.3  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  29.3 
 
 		 821 aa  88.2  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.77 
 
 		 847 aa  87.8  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 855 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 		 855 aa  85.5  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 		 834 aa  84.7  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  27.64 
 
 		 866 aa  84.3  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>