237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3477 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  55.04 
 
 		 853 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  65.95 
 
 		 867 aa  951    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  68.04 
 
 		 868 aa  1001    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 884 aa  1706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  56.66 
 
 		 855 aa  776    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  56.67 
 
 		 866 aa  753    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  69.91 
 
 		 857 aa  1031    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  63.61 
 
 		 877 aa  879    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  60.23 
 
 		 844 aa  802    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  63.49 
 
 		 877 aa  887    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  43.51 
 
 		 855 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  42.17 
 
 		 858 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  44.94 
 
 		 857 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  44.27 
 
 		 846 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  37.24 
 
 		 835 aa  364  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 		 835 aa  364  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  29.64 
 
 		 849 aa  250  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  42.45 
 
 		 408 aa  245  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  44.96 
 
 		 445 aa  227  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.47 
 
 		 858 aa  207  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.1 
 
 		 850 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.42 
 
 		 855 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.8 
 
 		 870 aa  170  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.37 
 
 		 850 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.38 
 
 		 851 aa  147  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  36.39 
 
 		 841 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  34.69 
 
 		 842 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  35.42 
 
 		 842 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  35.12 
 
 		 842 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  29.55 
 
 		 849 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 		 848 aa  115  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 839 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 849 aa  110  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.16 
 
 		 842 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  30.23 
 
 		 845 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.35 
 
 		 843 aa  102  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  21.14 
 
 		 817 aa  102  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  21.84 
 
 		 817 aa  100  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 		 847 aa  97.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 		 846 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.44 
 
 		 852 aa  94.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 		 847 aa  92.8  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 800 aa  92.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 		 837 aa  90.9  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  21.77 
 
 		 836 aa  89  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.9 
 
 		 866 aa  89  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  22.86 
 
 		 845 aa  88.6  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  20.82 
 
 		 817 aa  88.6  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.34 
 
 		 847 aa  87.4  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  21.52 
 
 		 836 aa  84.7  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  30.42 
 
 		 843 aa  83.2  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  37.35 
 
 		 843 aa  82.4  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  21.88 
 
 		 865 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  29.38 
 
 		 821 aa  81.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  22.33 
 
 		 897 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  26.38 
 
 		 857 aa  78.2  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  28.57 
 
 		 858 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  21.35 
 
 		 889 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  26.65 
 
 		 836 aa  77  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  21.74 
 
 		 879 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  21.53 
 
 		 889 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  21.34 
 
 		 884 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  29.49 
 
 		 819 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  21.88 
 
 		 878 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  25.5 
 
 		 820 aa  75.1  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  22.37 
 
 		 889 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  27.96 
 
 		 819 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  24.92 
 
 		 793 aa  74.7  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.99 
 
 		 845 aa  74.3  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  28.65 
 
 		 821 aa  72.8  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 		 855 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  22.38 
 
 		 887 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  22.54 
 
 		 887 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  27.69 
 
 		 819 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.66 
 
 		 855 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 866 aa  68.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  32.07 
 
 		 795 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  25.51 
 
 		 815 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 821 aa  68.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  26.98 
 
 		 826 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  30.09 
 
 		 855 aa  67  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  26.18 
 
 		 820 aa  67.4  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 		 834 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  30.7 
 
 		 853 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  21.47 
 
 		 840 aa  65.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  22.55 
 
 		 849 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 		 871 aa  61.6  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 		 845 aa  61.6  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.61 
 
 		 804 aa  61.6  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  27.15 
 
 		 820 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.75 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  20.49 
 
 		 803 aa  58.9  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  25.64 
 
 		 856 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 846 aa  57.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  25.41 
 
 		 825 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  26.14 
 
 		 827 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 		 873 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  39.51 
 
 		 859 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  27.3 
 
 		 819 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  22.18 
 
 		 896 aa  56.2  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>