More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2585 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  88.68 
 
 		 870 aa  1392    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  50.17 
 
 		 849 aa  788    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  55.24 
 
 		 845 aa  753    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  47.29 
 
 		 850 aa  722    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  44.16 
 
 		 847 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  44.28 
 
 		 847 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  100 
 
 		 866 aa  1681    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  47.4 
 
 		 839 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  42.48 
 
 		 855 aa  621  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  47.03 
 
 		 837 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  44.87 
 
 		 843 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  43.32 
 
 		 843 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  37.54 
 
 		 846 aa  325  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  28.86 
 
 		 858 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  34.93 
 
 		 841 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.29 
 
 		 842 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  29.68 
 
 		 851 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  28.33 
 
 		 850 aa  280  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 		 842 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  32.51 
 
 		 842 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 		 849 aa  259  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 849 aa  259  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  27.61 
 
 		 855 aa  240  8e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.59 
 
 		 858 aa  227  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  25.06 
 
 		 817 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  29.4 
 
 		 855 aa  218  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  26.09 
 
 		 889 aa  217  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 		 884 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  25.68 
 
 		 879 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.72 
 
 		 817 aa  213  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  26.09 
 
 		 889 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  28.41 
 
 		 844 aa  205  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  25.09 
 
 		 817 aa  203  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 857 aa  202  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  27.69 
 
 		 857 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  27.29 
 
 		 819 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  26.4 
 
 		 878 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  26.56 
 
 		 836 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27 
 
 		 846 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  26.43 
 
 		 897 aa  198  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  28.79 
 
 		 820 aa  197  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  28.04 
 
 		 877 aa  194  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 		 821 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 884 aa  194  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  27.15 
 
 		 887 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  26.69 
 
 		 887 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  24.66 
 
 		 865 aa  191  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  25.45 
 
 		 840 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.42 
 
 		 867 aa  190  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  26.79 
 
 		 889 aa  187  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  26.11 
 
 		 845 aa  187  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  27.27 
 
 		 868 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  27.29 
 
 		 825 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 		 835 aa  178  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 		 835 aa  178  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  27.01 
 
 		 866 aa  177  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  25.23 
 
 		 850 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.93 
 
 		 821 aa  171  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  28.61 
 
 		 793 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  25.63 
 
 		 849 aa  163  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  26.07 
 
 		 815 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  26.58 
 
 		 819 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.03 
 
 		 855 aa  157  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  27.52 
 
 		 826 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  27.86 
 
 		 821 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 800 aa  155  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  27.54 
 
 		 821 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.65 
 
 		 843 aa  147  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 		 803 aa  146  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 856 aa  142  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 834 aa  141  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  30.82 
 
 		 802 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 		 848 aa  137  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 		 852 aa  134  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.13 
 
 		 842 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  28.99 
 
 		 795 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  27.89 
 
 		 877 aa  127  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  30.64 
 
 		 872 aa  126  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  23.61 
 
 		 847 aa  124  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.71 
 
 		 841 aa  124  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 		 859 aa  120  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  25.41 
 
 		 849 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 		 408 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  25.54 
 
 		 849 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  27.7 
 
 		 836 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  28.49 
 
 		 820 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25 
 
 		 845 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  23.68 
 
 		 836 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.73 
 
 		 861 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 853 aa  110  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  29.69 
 
 		 819 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  28.49 
 
 		 819 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  31.07 
 
 		 853 aa  107  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.36 
 
 		 820 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 		 845 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  30.7 
 
 		 800 aa  103  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 873 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  21.86 
 
 		 813 aa  101  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.58 
 
 		 853 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  22.46 
 
 		 854 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>