74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1579 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  100 
 
 		 813 aa  1628    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  26.98 
 
 		 850 aa  198  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  25.32 
 
 		 889 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  25.27 
 
 		 836 aa  197  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  25.27 
 
 		 879 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 884 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26 
 
 		 836 aa  194  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  24.64 
 
 		 889 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 		 803 aa  190  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  24.97 
 
 		 865 aa  190  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  25.62 
 
 		 817 aa  187  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  27.76 
 
 		 849 aa  187  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  25.81 
 
 		 836 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  23.64 
 
 		 817 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  26.04 
 
 		 840 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.7 
 
 		 817 aa  180  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  26.07 
 
 		 845 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  25.28 
 
 		 820 aa  172  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  25.03 
 
 		 878 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  24.74 
 
 		 887 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  26.41 
 
 		 897 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  25.2 
 
 		 887 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 821 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  25.09 
 
 		 889 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 800 aa  154  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  25.5 
 
 		 802 aa  142  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  24.11 
 
 		 819 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  23.86 
 
 		 821 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  22.38 
 
 		 821 aa  137  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.22 
 
 		 849 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  23.98 
 
 		 804 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  23.07 
 
 		 815 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  23.83 
 
 		 793 aa  119  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  24.42 
 
 		 795 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  26.2 
 
 		 872 aa  101  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  22.15 
 
 		 839 aa  99  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  28.06 
 
 		 819 aa  99  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  25.29 
 
 		 826 aa  94  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  26.68 
 
 		 820 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  25.63 
 
 		 825 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  23.4 
 
 		 850 aa  89  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  21.23 
 
 		 870 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  19.71 
 
 		 855 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  27.27 
 
 		 819 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  21.2 
 
 		 866 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  25.63 
 
 		 753 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  24.6 
 
 		 842 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  21.41 
 
 		 845 aa  81.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  26.72 
 
 		 819 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  25.59 
 
 		 800 aa  75.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  24.59 
 
 		 820 aa  75.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  25.57 
 
 		 795 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 842 aa  70.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  24.21 
 
 		 841 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 842 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  28.43 
 
 		 795 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  22.66 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  23.17 
 
 		 821 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  22.61 
 
 		 843 aa  67.4  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  22.59 
 
 		 837 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  20.5 
 
 		 851 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  19.32 
 
 		 858 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  22.81 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.1 
 
 		 858 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  21.23 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  20.64 
 
 		 857 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  23.19 
 
 		 847 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  31.2 
 
 		 929 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  22.17 
 
 		 847 aa  55.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  19.49 
 
 		 846 aa  54.7  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  21.79 
 
 		 884 aa  51.2  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  32.08 
 
 		 843 aa  48.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  25.29 
 
 		 818 aa  45.8  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>