More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4186 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  100 
 
 		 828 aa  1537    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  37.58 
 
 		 855 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  36.61 
 
 		 861 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  36.42 
 
 		 836 aa  350  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  35.98 
 
 		 841 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  37.23 
 
 		 825 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  33.68 
 
 		 843 aa  320  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  34.85 
 
 		 847 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  39.7 
 
 		 839 aa  313  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 		 848 aa  306  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  34.51 
 
 		 838 aa  304  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 842 aa  300  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  38.08 
 
 		 846 aa  286  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  33.37 
 
 		 834 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  31.9 
 
 		 852 aa  270  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  34.62 
 
 		 861 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  33.94 
 
 		 849 aa  267  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  32.69 
 
 		 845 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  35.21 
 
 		 857 aa  261  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  32.33 
 
 		 873 aa  260  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  35.05 
 
 		 849 aa  258  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  32.13 
 
 		 859 aa  244  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  30.61 
 
 		 853 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  33.71 
 
 		 806 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  33.69 
 
 		 853 aa  232  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  35.06 
 
 		 855 aa  227  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  28.22 
 
 		 854 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  33.79 
 
 		 857 aa  226  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  29.94 
 
 		 856 aa  221  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 		 897 aa  217  5e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  36.38 
 
 		 871 aa  213  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  35.06 
 
 		 853 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 		 878 aa  209  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.98 
 
 		 859 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 		 866 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 		 930 aa  187  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  30.72 
 
 		 855 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.34 
 
 		 835 aa  167  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.31 
 
 		 821 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  35.26 
 
 		 846 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.96 
 
 		 880 aa  124  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  29.2 
 
 		 822 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.18 
 
 		 863 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  41.62 
 
 		 873 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 		 855 aa  105  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  33.63 
 
 		 801 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.09 
 
 		 850 aa  97.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.3 
 
 		 849 aa  94.7  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.87 
 
 		 854 aa  93.2  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  29.55 
 
 		 852 aa  90.9  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.21 
 
 		 858 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 		 849 aa  87.8  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.44 
 
 		 851 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.9 
 
 		 870 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  19.27 
 
 		 857 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 		 849 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27.29 
 
 		 858 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.71 
 
 		 856 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  56.52 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 		 857 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.32 
 
 		 850 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.08 
 
 		 866 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  17.73 
 
 		 858 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  25.52 
 
 		 846 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.92 
 
 		 843 aa  71.6  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.26 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26.32 
 
 		 857 aa  71.6  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 822 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  34.53 
 
 		 488 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.43 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 		 884 aa  69.3  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  34.48 
 
 		 842 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 828 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  18.99 
 
 		 829 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  18.99 
 
 		 829 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  21.86 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  26.48 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.37 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.43 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.24 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.26 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  27.99 
 
 		 838 aa  63.9  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.24 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  23.81 
 
 		 414 aa  62  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  20.83 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  27.18 
 
 		 829 aa  62.4  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.73 
 
 		 420 aa  62  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 833 aa  62  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  32.92 
 
 		 842 aa  61.6  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  23.15 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  23.63 
 
 		 885 aa  61.2  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  21.26 
 
 		 393 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  23.47 
 
 		 415 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  26.49 
 
 		 868 aa  60.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  19.22 
 
 		 684 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 		 402 aa  60.1  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.49 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>