240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1146 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  100 
 
 
787 aa  1580    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  30.21 
 
 
791 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  30.39 
 
 
792 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  31.27 
 
 
788 aa  328  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  30.24 
 
 
787 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  29.69 
 
 
787 aa  317  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 
787 aa  316  9e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 
797 aa  312  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  29.98 
 
 
787 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 
792 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 
787 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 
787 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  28.84 
 
 
787 aa  293  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  29.79 
 
 
789 aa  292  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  27.81 
 
 
789 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  29.58 
 
 
788 aa  284  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  29.63 
 
 
793 aa  283  9e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  28.84 
 
 
793 aa  281  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  29.92 
 
 
786 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  28.59 
 
 
787 aa  269  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  28.36 
 
 
787 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
792 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  29.81 
 
 
786 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  26.43 
 
 
787 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 
789 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 
789 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  27.27 
 
 
791 aa  264  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 
786 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 
786 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  25.66 
 
 
788 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  28.91 
 
 
788 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 
790 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  27.99 
 
 
789 aa  254  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  31.08 
 
 
787 aa  250  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  27.36 
 
 
800 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  28.01 
 
 
793 aa  244  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  27.52 
 
 
787 aa  242  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 
787 aa  236  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  30.52 
 
 
786 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  28.09 
 
 
788 aa  236  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  26.74 
 
 
787 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  28.32 
 
 
790 aa  228  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  27.03 
 
 
789 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 
774 aa  173  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  20.6 
 
 
773 aa  146  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  23.24 
 
 
947 aa  140  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 
759 aa  130  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  21.34 
 
 
1090 aa  124  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 
1016 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 
1177 aa  114  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  22.03 
 
 
868 aa  114  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  21.75 
 
 
1132 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  21.25 
 
 
1132 aa  107  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  26.58 
 
 
806 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 
1143 aa  97.8  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.44 
 
 
876 aa  94.4  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  20.28 
 
 
859 aa  94.4  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 
1110 aa  84.3  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  21.23 
 
 
1068 aa  81.6  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  22.16 
 
 
749 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  22.52 
 
 
917 aa  78.6  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  25.99 
 
 
876 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 
822 aa  74.3  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  18.59 
 
 
737 aa  74.3  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  22.04 
 
 
1232 aa  73.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.16 
 
 
811 aa  73.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.22 
 
 
863 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 
834 aa  65.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  24.81 
 
 
828 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  27.32 
 
 
411 aa  64.3  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 
833 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  18.39 
 
 
743 aa  63.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.69 
 
 
856 aa  62.4  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
848 aa  62  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.9 
 
 
397 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 
873 aa  60.1  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
873 aa  59.3  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  24.64 
 
 
408 aa  59.3  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.53 
 
 
411 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.76 
 
 
408 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26 
 
 
847 aa  57.4  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 
806 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.61 
 
 
389 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.48 
 
 
415 aa  55.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.75 
 
 
427 aa  55.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.81 
 
 
847 aa  55.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.05 
 
 
1211 aa  55.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 
386 aa  55.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  23.75 
 
 
505 aa  55.1  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 
853 aa  54.3  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  29.8 
 
 
414 aa  54.3  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  26.2 
 
 
851 aa  54.3  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26 
 
 
855 aa  53.9  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  36.69 
 
 
643 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.95 
 
 
399 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.99 
 
 
386 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.88 
 
 
461 aa  53.5  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 
383 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 
400 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.75 
 
 
401 aa  53.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>