More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3549 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 386 aa  753    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 		 430 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  31.74 
 
 		 430 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.2 
 
 		 418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  29.36 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  29.36 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  29.19 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26.88 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  25.24 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  32.12 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  28.5 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  26.28 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  26.39 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.74 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  25.13 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.69 
 
 		 434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  23.79 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  24.16 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.02 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  27.27 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 		 386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.6 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  26.03 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  27.78 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  21.85 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  22.25 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  22.25 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  21.5 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  21.96 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  22.61 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  23.65 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  25.51 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  22.33 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  22.28 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  25.3 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  22.28 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.21 
 
 		 407 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  29.3 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  28.57 
 
 		 488 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  22.28 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  35 
 
 		 462 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.25 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  26.91 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  23.02 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  32.8 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.91 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.8 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.88 
 
 		 863 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  27.2 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.43 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  26.05 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30.71 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  30 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.75 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.34 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25.66 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  29.29 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.66 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.46 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  30 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  23.04 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.86 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.45 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.51 
 
 		 841 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  29.94 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  28.57 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.11 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  34.39 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2537  hypothetical protein  24.38 
 
 		 793 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.22202  hitchhiker  0.0000000191831 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.86 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.07 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  33.12 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.37 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.64 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  24.44 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.77 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.73 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  21.62 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  29.66 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  28.57 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1642  hypothetical protein  27.36 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  24.34 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1012  hypothetical protein  26.38 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000255652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>