More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0164 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 455 aa  925    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  57.56 
 
 		 407 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  25.16 
 
 		 430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  24.73 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  34.72 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  24.1 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  29.79 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  21.56 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  21.56 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  32.19 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 		 376 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  30.59 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  30.14 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  23.92 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  21.21 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.29 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  31.79 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  37.33 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  26.48 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  27.62 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.07 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.82 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.93 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  20.35 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  26.11 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  21.23 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  26.09 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.11 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.87 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  27.97 
 
 		 413 aa  67  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 		 408 aa  67  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.3 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  34.33 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.59 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.21 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  28.14 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.49 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  25.06 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  28.76 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.73 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  26.64 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.82 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  26.09 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.63 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  24.38 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  24.38 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  24.38 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  24.38 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  24.38 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  30.43 
 
 		 1207 aa  63.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  24.59 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  34.96 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25.41 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  29.76 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  31.21 
 
 		 715 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  21.51 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  24.57 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  31.69 
 
 		 885 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  37.84 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  34.03 
 
 		 1130 aa  61.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  23.95 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.42 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  31.06 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.39 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  21.53 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  38.83 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.63 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  32.58 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  36.19 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  29.58 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.28 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  24.61 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2472  protein of unknown function DUF214  33.91 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  30.07 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  31.21 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  32.17 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.68 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.4 
 
 		 862 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>