212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1868 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 370 aa  727    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  30.77 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  29.85 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  26.72 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  28.42 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  27.34 
 
 		 425 aa  122  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.7 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  27.1 
 
 		 429 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  26.46 
 
 		 429 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.24 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  25.94 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  25.37 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  25.37 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  22.81 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.27 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  25.27 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  23.17 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  21.85 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  23.89 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  21.09 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.2 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  26.7 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.54 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  26.44 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.02 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  24.84 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  21.81 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  22.05 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.88 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  21.74 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  20.43 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.12 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.61 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0939  lipoprotein release system transmembrane protein  26.52 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.866637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  30.77 
 
 		 1207 aa  56.2  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  24.07 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  22.19 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0355  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.966338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.1 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  25.78 
 
 		 407 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  31.88 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  31.78 
 
 		 453 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.36 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.34 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.99 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.92 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0781  ABC lipoprotein exporter, inner membrane subunit, LolE  26.42 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  34.51 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.82 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0787  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.42 
 
 		 411 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000127174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  26.52 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  31.86 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  31.86 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.87 
 
 		 443 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 		 856 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  30.58 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.95 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.95 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 		 952 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  28.8 
 
 		 885 aa  49.7  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.09 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  21.24 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  32.04 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  30.47 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.39 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  24.45 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.47 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  25 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.526116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.21 
 
 		 882 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  25.45 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  24.43 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.85 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  27.54 
 
 		 849 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  31.07 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  31.25 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.74 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.01 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  25.32 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2201  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  26.81 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>