More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1073 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  754    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  53.62 
 
 
401 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  50.86 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  50.88 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  50.88 
 
 
400 aa  381  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  52.43 
 
 
401 aa  379  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  32.62 
 
 
425 aa  187  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1012  hypothetical protein  37.08 
 
 
373 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.976077  hitchhiker  0.00121188 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0080  hypothetical protein  35.29 
 
 
373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1403  hypothetical protein  31.73 
 
 
393 aa  138  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  24.37 
 
 
367 aa  103  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  27.01 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 
386 aa  93.6  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.98 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.16 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.15 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 
414 aa  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.96 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  22.3 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  24.58 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.06 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  24.02 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  24.64 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  25.31 
 
 
654 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  24.45 
 
 
657 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  24.29 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.88 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  30.8 
 
 
855 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.47 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.64 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  27.05 
 
 
643 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.31 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  24.94 
 
 
654 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.78 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  23.89 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28.31 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.11 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.02 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  32.7 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  24.17 
 
 
658 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.06 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  25.42 
 
 
396 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  27.12 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.89 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  28.76 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  25.62 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.8 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  28.86 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  29.35 
 
 
836 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  26.37 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2608  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  32 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  28.73 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.13 
 
 
649 aa  72.8  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  27.57 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  24.15 
 
 
657 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  36.43 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.88 
 
 
649 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  24.82 
 
 
654 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.53 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  23 
 
 
663 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  23.49 
 
 
656 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.12 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.56 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  24.44 
 
 
656 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  22.49 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.47 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.83 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.3 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  26.3 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  33.83 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  21.34 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  24.65 
 
 
662 aa  70.5  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  22.95 
 
 
663 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  26.3 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.15 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  21.34 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 
834 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.78 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  27.04 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  24.23 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  20 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.85 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  28 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>