More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0770 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  824    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  38.46 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  34.03 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  33.33 
 
 
401 aa  209  6e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  33.25 
 
 
384 aa  206  6e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  33.25 
 
 
400 aa  200  3e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  32.08 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1403  hypothetical protein  28.2 
 
 
393 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  29.02 
 
 
409 aa  117  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1012  hypothetical protein  29.28 
 
 
373 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.976077  hitchhiker  0.00121188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1742  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
418 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0080  hypothetical protein  28.71 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  26.92 
 
 
387 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  23.97 
 
 
367 aa  90.5  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2608  protein of unknown function DUF214  26.74 
 
 
395 aa  89.7  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  24.15 
 
 
399 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.58 
 
 
649 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.01 
 
 
649 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  30.29 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.58 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.89 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  24.94 
 
 
657 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  25.99 
 
 
696 aa  80.1  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  26.8 
 
 
656 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.61 
 
 
648 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.56 
 
 
648 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.38 
 
 
395 aa  79  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  24.38 
 
 
648 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  24.38 
 
 
648 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.38 
 
 
648 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.38 
 
 
648 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.38 
 
 
648 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  24.38 
 
 
648 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.89 
 
 
399 aa  77  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  26.22 
 
 
653 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  23.44 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.16 
 
 
648 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.11 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.72 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.9 
 
 
646 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  22.1 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  22.1 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  26.91 
 
 
651 aa  73.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  23.53 
 
 
649 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 
792 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  24.72 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  22.15 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  24.54 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  24.72 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.02 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  24.29 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  25.1 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  23.3 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  25.35 
 
 
668 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  26.12 
 
 
667 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  21.94 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  23.53 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  23.35 
 
 
647 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  28.07 
 
 
651 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  29.95 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  26.12 
 
 
667 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  26.12 
 
 
682 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.95 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  26.12 
 
 
682 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  25.1 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  24.23 
 
 
687 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.07 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  22.07 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  22.6 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 
846 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  25.3 
 
 
652 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  25.63 
 
 
648 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  22.67 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.11 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  25.76 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  21.08 
 
 
654 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.93 
 
 
656 aa  67  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  24.32 
 
 
643 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  21.16 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  24.89 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  21.64 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  24.2 
 
 
671 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  23.98 
 
 
650 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  23.19 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  27.59 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  23.19 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  24.84 
 
 
681 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>