More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0355 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0355  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
228 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.966338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0733  hypothetical protein  53.92 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0253  hypothetical protein  45.37 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  42.52 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  43.31 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  39.69 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  41.6 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  37.69 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  37.9 
 
 
397 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  43.65 
 
 
400 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  42.31 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  42.86 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  36.29 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  41.41 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  34.33 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  35.94 
 
 
430 aa  72.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  38.17 
 
 
412 aa  71.6  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  37.5 
 
 
381 aa  71.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  36.36 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  36.72 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  41.32 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  37.1 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  39.52 
 
 
413 aa  69.3  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  36.92 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  36.31 
 
 
387 aa  68.6  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
404 aa  68.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  37.5 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  40.8 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  37.21 
 
 
400 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  39.84 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  37.9 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  40.62 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.85 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  38.4 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  39.68 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  30.28 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  38.21 
 
 
412 aa  65.9  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  38.89 
 
 
418 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  34.53 
 
 
467 aa  65.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  37.88 
 
 
411 aa  65.5  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  40.5 
 
 
402 aa  65.1  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  40.68 
 
 
409 aa  65.1  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  38.76 
 
 
403 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  39.85 
 
 
416 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  40.8 
 
 
405 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  38.58 
 
 
404 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  39.85 
 
 
410 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  34.68 
 
 
390 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  40.8 
 
 
405 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  31.25 
 
 
404 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  29.58 
 
 
415 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  37.1 
 
 
401 aa  63.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  38.58 
 
 
415 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  34.31 
 
 
411 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  39.67 
 
 
404 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  34.11 
 
 
423 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  38.52 
 
 
407 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  32.5 
 
 
410 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.12 
 
 
437 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  37.01 
 
 
410 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  37.8 
 
 
409 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  38.98 
 
 
656 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  58.33 
 
 
502 aa  62.8  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  33.57 
 
 
414 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  39.2 
 
 
403 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  36.43 
 
 
402 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30.28 
 
 
414 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3213  protein of unknown function DUF214  42.52 
 
 
411 aa  62.4  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.138688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  35.11 
 
 
423 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  41.09 
 
 
400 aa  61.6  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  34.11 
 
 
414 aa  61.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  35.66 
 
 
402 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  35.43 
 
 
398 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0787  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.33 
 
 
411 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000127174  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.71 
 
 
651 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
391 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  33.61 
 
 
411 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  35.66 
 
 
402 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  40.98 
 
 
405 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  39.67 
 
 
405 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
383 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  39.84 
 
 
391 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
384 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
443 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  39.84 
 
 
391 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  39.84 
 
 
391 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  39.84 
 
 
391 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
383 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
391 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  40 
 
 
400 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  39.84 
 
 
391 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  36.23 
 
 
414 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  29.58 
 
 
414 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
416 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.87 
 
 
411 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  34.13 
 
 
642 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  37.9 
 
 
412 aa  60.1  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  39.84 
 
 
407 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>