More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0253 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0253  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0355  protein of unknown function DUF214  45.37 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.966338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0733  hypothetical protein  45.33 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  35.48 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  36.51 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  36.51 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  36.72 
 
 		 430 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  34.25 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  38.28 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  42.19 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003990  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  34.29 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  38.71 
 
 		 656 aa  70.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  33.85 
 
 		 414 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.75 
 
 		 420 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01532  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  33.83 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  33.33 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  31.4 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.75 
 
 		 424 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  32.88 
 
 		 416 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.04 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 		 658 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  39.52 
 
 		 657 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  38.46 
 
 		 409 aa  65.1  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  35.48 
 
 		 653 aa  65.1  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  36.8 
 
 		 406 aa  64.7  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  37.3 
 
 		 413 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  37.69 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  33.6 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  37.01 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  36.29 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  38.76 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.8 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  39.52 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  39.52 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  39.52 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  39.52 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  31.06 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  39.52 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  36.69 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  36.29 
 
 		 410 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  34.68 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  36.84 
 
 		 456 aa  62.4  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  37.41 
 
 		 422 aa  62  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  39.52 
 
 		 383 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  33.6 
 
 		 397 aa  61.6  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  30.56 
 
 		 421 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  31.75 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.51 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  34.92 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  35.48 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  36.92 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  37.1 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  37.3 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  36 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  32.26 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  37.6 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  37.3 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  32.79 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  34.65 
 
 		 821 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  33.59 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  30.08 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  39.39 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  39.52 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.86 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.52 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  37.3 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1506  protein of unknown function DUF214  34.68 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.314558  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  35.2 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  37.3 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  32.31 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  34.68 
 
 		 452 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  37.3 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  33.08 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  39.34 
 
 		 851 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  36.84 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  35.2 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0781  ABC lipoprotein exporter, inner membrane subunit, LolE  30.77 
 
 		 411 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  30.37 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  30.65 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2360  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.35 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.069448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 		 412 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  35.71 
 
 		 397 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 649 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  30.47 
 
 		 650 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  37.1 
 
 		 409 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>