More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1801 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 412 aa  825    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  55.37 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  28.23 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  27.23 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  26.62 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  28.37 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 830 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  26.73 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  28.97 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  28.61 
 
 		 421 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  26.68 
 
 		 429 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 		 436 aa  126  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  28.33 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  27.74 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  26.11 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  26.86 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 441 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.07 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.29 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  27.84 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  24.71 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  27.44 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  25.28 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  28.3 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  25.69 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.29 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  25.18 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.58 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.09 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  30.11 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  28.6 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1332  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.71 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1697  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.29 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.92 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.84 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 		 295 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14710  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  26.42 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.016176  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.05 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.08 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  25.12 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.05 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.57 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.29 
 
 		 421 aa  97.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.33 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  26.68 
 
 		 405 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  23.78 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.55 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.94 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.84 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.42 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2783  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.32 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  27.08 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.94 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.11 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  25.14 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  23.31 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.66 
 
 		 416 aa  93.2  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  24.57 
 
 		 416 aa  93.2  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  24.56 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2475  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.03 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3859  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.85 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  25.23 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.43 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.79 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.29 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.43 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  25.49 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.64 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.26 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.46 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3588  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.79 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  23.31 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.79 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1545  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.46 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0135691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25.36 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  27.09 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.97 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.63 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1676  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.13 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596735  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.56 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.29 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25.29 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0787  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.3 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000127174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  26.8 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  24.07 
 
 		 433 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  23.35 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.26 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  24.15 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.94 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>