More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0733 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0733  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0355  protein of unknown function DUF214  53.92 
 
 
228 aa  205  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.966338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0253  hypothetical protein  45.33 
 
 
218 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  40.32 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  44.09 
 
 
452 aa  82.4  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  41.6 
 
 
443 aa  79.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 
404 aa  79  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  42.52 
 
 
410 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  41.6 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  36.64 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  38.4 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  36.92 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  37.9 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  38.71 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  42.4 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  36.8 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  44 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  38.76 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  40.46 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  40.58 
 
 
410 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  43.2 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  36.51 
 
 
387 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  36.29 
 
 
386 aa  71.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
423 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  32.82 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  39.06 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  37.9 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.9 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  39.86 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  34.44 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  39.37 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  41.6 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.43 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  37.6 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 
410 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.2 
 
 
406 aa  68.9  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  32.45 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  35.71 
 
 
841 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  36.22 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  38.52 
 
 
406 aa  67  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  29.86 
 
 
414 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  41.27 
 
 
412 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  34.31 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  37.5 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  33.12 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  34.38 
 
 
650 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  36.17 
 
 
452 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  36.29 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  41.6 
 
 
663 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  36.36 
 
 
453 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  41.13 
 
 
412 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  43.55 
 
 
399 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  37.5 
 
 
414 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  36.72 
 
 
421 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.41 
 
 
424 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  36.43 
 
 
405 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 
416 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  40.94 
 
 
418 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  35.2 
 
 
401 aa  64.3  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  39.68 
 
 
409 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  32 
 
 
410 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 
423 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  40.32 
 
 
657 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  37.21 
 
 
398 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.78 
 
 
411 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  38.71 
 
 
402 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  37.01 
 
 
454 aa  63.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  39.52 
 
 
405 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  36.51 
 
 
410 aa  63.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  38.71 
 
 
402 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  35.48 
 
 
408 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  33.33 
 
 
402 aa  63.2  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  37.3 
 
 
400 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  31.3 
 
 
390 aa  62.8  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.68 
 
 
413 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  35.59 
 
 
409 aa  63.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003990  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  34.27 
 
 
414 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  29.77 
 
 
952 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
391 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  37.5 
 
 
403 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  36.15 
 
 
400 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  30.67 
 
 
641 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  37.3 
 
 
653 aa  62  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  33.87 
 
 
403 aa  62  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  37.1 
 
 
412 aa  62  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01532  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  35.77 
 
 
407 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  38.52 
 
 
400 aa  62  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  30.33 
 
 
395 aa  62  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  30.71 
 
 
420 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  36.29 
 
 
410 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  34.88 
 
 
696 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  40.16 
 
 
654 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  33.87 
 
 
406 aa  61.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  36.8 
 
 
456 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  35.66 
 
 
715 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.14 
 
 
420 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  30 
 
 
641 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>