More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01070 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 1207 aa  2446    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  43.66 
 
 		 1090 aa  639    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  37.92 
 
 		 1130 aa  502  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  69.67 
 
 		 950 aa  376  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  71.56 
 
 		 885 aa  360  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  72 
 
 		 888 aa  357  8.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  67.4 
 
 		 779 aa  342  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  68.44 
 
 		 903 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  61.57 
 
 		 779 aa  327  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 643 aa  251  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  50.64 
 
 		 664 aa  238  6e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  50.22 
 
 		 664 aa  234  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  48.66 
 
 		 662 aa  224  9e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  44.96 
 
 		 653 aa  222  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  50 
 
 		 228 aa  221  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  47.75 
 
 		 244 aa  217  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  47.39 
 
 		 660 aa  217  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  48.18 
 
 		 240 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48 
 
 		 232 aa  216  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.65 
 
 		 226 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.77 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.77 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  214  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.78 
 
 		 237 aa  214  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 248 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.78 
 
 		 225 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 		 645 aa  212  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 226 aa  212  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.2 
 
 		 237 aa  212  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  47.09 
 
 		 236 aa  211  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47.09 
 
 		 230 aa  211  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  48.43 
 
 		 233 aa  211  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.5 
 
 		 228 aa  211  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.66 
 
 		 230 aa  211  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 226 aa  210  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 226 aa  210  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 226 aa  210  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 226 aa  210  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.67 
 
 		 239 aa  210  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 226 aa  211  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 226 aa  210  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.98 
 
 		 229 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 226 aa  210  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.54 
 
 		 242 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 227 aa  209  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 246 aa  210  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 226 aa  209  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  46.67 
 
 		 229 aa  209  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.95 
 
 		 230 aa  208  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.85 
 
 		 242 aa  209  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  46.85 
 
 		 233 aa  208  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 226 aa  208  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.98 
 
 		 244 aa  207  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  45.91 
 
 		 224 aa  207  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.85 
 
 		 247 aa  207  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  46.4 
 
 		 226 aa  206  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 240 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.38 
 
 		 236 aa  205  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 221 aa  206  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  49.31 
 
 		 660 aa  205  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 228 aa  205  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.92 
 
 		 649 aa  205  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  47.3 
 
 		 260 aa  205  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.75 
 
 		 225 aa  204  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.74 
 
 		 226 aa  204  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  46.4 
 
 		 228 aa  205  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  47.75 
 
 		 238 aa  204  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  48.42 
 
 		 250 aa  204  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.77 
 
 		 253 aa  204  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  43.8 
 
 		 652 aa  203  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.77 
 
 		 253 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 233 aa  202  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  45.5 
 
 		 240 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.74 
 
 		 230 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 228 aa  202  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  46.88 
 
 		 230 aa  202  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  49.33 
 
 		 226 aa  201  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  47.75 
 
 		 239 aa  201  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.19 
 
 		 649 aa  201  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  49.32 
 
 		 228 aa  201  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.39 
 
 		 642 aa  201  9e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.09 
 
 		 239 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.84 
 
 		 642 aa  200  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 236 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  46.86 
 
 		 248 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 228 aa  200  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.66 
 
 		 252 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.22 
 
 		 648 aa  200  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  48.88 
 
 		 245 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  41.61 
 
 		 715 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  45.19 
 
 		 652 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 236 aa  199  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  42.35 
 
 		 668 aa  199  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.09 
 
 		 241 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.96 
 
 		 230 aa  198  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.85 
 
 		 225 aa  198  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 222 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  47.73 
 
 		 241 aa  198  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  48.87 
 
 		 655 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 		 233 aa  197  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>