More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2021 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  98.37 
 
 
429 aa  843    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
429 aa  856    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  99.07 
 
 
429 aa  849    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  57.83 
 
 
430 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  52.69 
 
 
430 aa  427  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  52.56 
 
 
430 aa  426  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  52.33 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  49.52 
 
 
426 aa  356  5e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  36.32 
 
 
430 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 
430 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  34.79 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  35.02 
 
 
429 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  36.74 
 
 
429 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.01 
 
 
418 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  33.26 
 
 
425 aa  232  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  30.34 
 
 
434 aa  205  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
444 aa  201  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  35.28 
 
 
314 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
408 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  26.71 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 
372 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  27.85 
 
 
372 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  23.19 
 
 
376 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  23.19 
 
 
393 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  21.79 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  29 
 
 
372 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  25.06 
 
 
380 aa  106  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  26.08 
 
 
371 aa  106  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 
379 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.13 
 
 
380 aa  103  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  22.69 
 
 
379 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  26.13 
 
 
376 aa  99  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.45 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.24 
 
 
386 aa  94  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.9 
 
 
386 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.34 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.45 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  22.63 
 
 
373 aa  89  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  22.4 
 
 
386 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.57 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.6 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  23.45 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  22.2 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  21.45 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  20 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  20.45 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  21.05 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.73 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.61 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.73 
 
 
397 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.38 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.52 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  22.49 
 
 
389 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  23.43 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  22.57 
 
 
404 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.33 
 
 
413 aa  63.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  22.09 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  22.45 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  22.22 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.54 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  22.35 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  20.79 
 
 
399 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  21.67 
 
 
656 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  23.33 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  24.6 
 
 
856 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  24.32 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  33.06 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  21 
 
 
401 aa  57.4  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 
410 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  30 
 
 
488 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 
405 aa  56.6  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  19.1 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  29.35 
 
 
467 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  24.03 
 
 
858 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.32 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  20.99 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  20.99 
 
 
658 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  21.93 
 
 
796 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  25.72 
 
 
857 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 
852 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  23.64 
 
 
643 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  20.27 
 
 
648 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  24.43 
 
 
864 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  23.27 
 
 
431 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.62 
 
 
653 aa  53.5  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  22.8 
 
 
414 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  20.54 
 
 
401 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  33 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  19.82 
 
 
648 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  21.32 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  19.82 
 
 
648 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2537  hypothetical protein  28.69 
 
 
793 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.22202  hitchhiker  0.0000000191831 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  27.41 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  25.37 
 
 
400 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  19.82 
 
 
648 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  23.14 
 
 
854 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>