More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0895 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  774    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  69.25 
 
 
387 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  68.73 
 
 
385 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  28.24 
 
 
389 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  27.89 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  27.05 
 
 
386 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.68 
 
 
397 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 
386 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.05 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.35 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  26.8 
 
 
397 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  32.36 
 
 
397 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  27.36 
 
 
397 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  26.3 
 
 
397 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.82 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  26 
 
 
387 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  26.01 
 
 
386 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  26.18 
 
 
386 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.1 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  26.27 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  28.93 
 
 
397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  27.89 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 
405 aa  115  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  25.5 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  27.43 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.23 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  25.68 
 
 
397 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  26.67 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  30.05 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 
386 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  29.35 
 
 
381 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  24.82 
 
 
414 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 
397 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  24.7 
 
 
404 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  27.27 
 
 
397 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  25.87 
 
 
385 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  24.47 
 
 
404 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  26.09 
 
 
411 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  24.13 
 
 
395 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.57 
 
 
439 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  27.5 
 
 
671 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  24.82 
 
 
404 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  27.54 
 
 
645 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  27.65 
 
 
656 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 
430 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 
413 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 
400 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  25.94 
 
 
389 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.19 
 
 
420 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  27.12 
 
 
400 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  25.61 
 
 
400 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  28 
 
 
414 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 
413 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 
404 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.01 
 
 
414 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.29 
 
 
402 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
401 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 
415 aa  99.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  26.65 
 
 
657 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.89 
 
 
390 aa  99.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.79 
 
 
426 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  26.2 
 
 
394 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  31.34 
 
 
394 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.87 
 
 
422 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  26.54 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  24.81 
 
 
663 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  28.4 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  26.82 
 
 
654 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  26.6 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.48 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.16 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.86 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  25 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  25.25 
 
 
663 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  24.76 
 
 
414 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.71 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.11 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  25.85 
 
 
661 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.54 
 
 
656 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  25.43 
 
 
657 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.88 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  25.54 
 
 
656 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  26.75 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.85 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  26.27 
 
 
644 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.44 
 
 
488 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  25.86 
 
 
658 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  33.13 
 
 
408 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 
403 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  26.5 
 
 
651 aa  93.6  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.42 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>