More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1894 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
385 aa  758    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  68.73 
 
 
387 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  64.6 
 
 
387 aa  494  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 
386 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  27.23 
 
 
389 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  28.92 
 
 
386 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  29.92 
 
 
386 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  27.61 
 
 
397 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  26.45 
 
 
387 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 
386 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  26.93 
 
 
397 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.62 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.75 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
386 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.91 
 
 
414 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 
400 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  26.42 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  26.43 
 
 
397 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.44 
 
 
397 aa  129  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  28.54 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  27.79 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 
386 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  26.85 
 
 
397 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  27.55 
 
 
397 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.5 
 
 
414 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.09 
 
 
401 aa  125  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.01 
 
 
405 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  30.22 
 
 
407 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.85 
 
 
401 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  25.51 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  28.5 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.07 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  26.33 
 
 
397 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  30.4 
 
 
401 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  30.4 
 
 
401 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  32.8 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  27.68 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.58 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  28.2 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  29.86 
 
 
381 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.81 
 
 
404 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  22.84 
 
 
395 aa  116  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  29.06 
 
 
408 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.56 
 
 
397 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.57 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  29.43 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.23 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.56 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  30.41 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  28.77 
 
 
414 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
405 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  27.21 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.82 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.42 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.03 
 
 
657 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  29.87 
 
 
671 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  26.76 
 
 
400 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  26.85 
 
 
405 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  28 
 
 
385 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  33.22 
 
 
488 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  29.57 
 
 
644 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 
397 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  28.57 
 
 
401 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  24.64 
 
 
443 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  30.28 
 
 
403 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 
406 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  28.47 
 
 
400 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  25.3 
 
 
411 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
402 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  25.87 
 
 
402 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.22 
 
 
402 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30 
 
 
402 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 
467 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  31.11 
 
 
394 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 
403 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  28.4 
 
 
412 aa  103  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  27.14 
 
 
657 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.21 
 
 
399 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.57 
 
 
400 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  25.53 
 
 
414 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  28.54 
 
 
656 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
405 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  26.28 
 
 
404 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
407 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.44 
 
 
397 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
405 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.3 
 
 
413 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.19 
 
 
409 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.27 
 
 
408 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  23.24 
 
 
422 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  26.83 
 
 
707 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  25.85 
 
 
395 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  28.25 
 
 
402 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  26.62 
 
 
394 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  28.08 
 
 
648 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  27.45 
 
 
661 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  28.08 
 
 
648 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>