More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0317 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  75.36 
 
 
422 aa  649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  80.33 
 
 
422 aa  694    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  71.56 
 
 
422 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
422 aa  837    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  73.22 
 
 
422 aa  630  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  68.72 
 
 
422 aa  594  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0385  protein of unknown function DUF214  68.96 
 
 
422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0295868  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  34.13 
 
 
422 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000928533  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  30.05 
 
 
424 aa  213  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 
424 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0551  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000638831  normal  0.237108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0590  hypothetical protein  29.69 
 
 
424 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  30.5 
 
 
422 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.526116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  28.8 
 
 
416 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 
417 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  29.37 
 
 
416 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  27.84 
 
 
411 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  26.78 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  26.78 
 
 
416 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  26.13 
 
 
419 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.56 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
416 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  27.19 
 
 
423 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.59 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.78 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.54 
 
 
424 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.11 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.11 
 
 
389 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.47 
 
 
389 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.5 
 
 
420 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  27.29 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 
401 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.56 
 
 
418 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
405 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.62 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.22 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.23 
 
 
416 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.77 
 
 
415 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  25.42 
 
 
409 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  24.15 
 
 
414 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.15 
 
 
414 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.65 
 
 
414 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  26.7 
 
 
420 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2836  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.21 
 
 
415 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620052  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  25.81 
 
 
385 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.23 
 
 
408 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.16 
 
 
414 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.44 
 
 
414 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  26.22 
 
 
408 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.39 
 
 
413 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  22.84 
 
 
414 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.27 
 
 
415 aa  103  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0384  lipoprotein releasing system transmembrane protein  22.73 
 
 
413 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.35 
 
 
411 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  23.65 
 
 
414 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.81 
 
 
422 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.22 
 
 
417 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.81 
 
 
422 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  22.96 
 
 
427 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.78 
 
 
414 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0348  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.5 
 
 
413 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  22.03 
 
 
408 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1811  addiction module toxin, Txe/YoeB  24.04 
 
 
412 aa  99.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.76 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  24.76 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.01 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  22.65 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  26.63 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.54 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14690  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  24.44 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.09 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  24.73 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  22.65 
 
 
433 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  23.62 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  23.69 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.86 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14710  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  23.28 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.016176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  23.62 
 
 
416 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 
408 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 
952 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.28 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.8 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.85 
 
 
416 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.66 
 
 
448 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.92 
 
 
414 aa  93.6  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.93 
 
 
417 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.93 
 
 
417 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.66 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 
416 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.66 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.66 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.3 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.66 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.66 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  24.28 
 
 
416 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  23.02 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1697  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.05 
 
 
413 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.15 
 
 
424 aa  91.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>