More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0385 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0385  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
422 aa  841    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0295868  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  71.09 
 
 
422 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  72.27 
 
 
422 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  69.91 
 
 
422 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  68.96 
 
 
422 aa  595  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  67.3 
 
 
422 aa  592  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  68.48 
 
 
422 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  35.01 
 
 
422 aa  233  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000928533  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 
424 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0551  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
422 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000638831  normal  0.237108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  31.81 
 
 
424 aa  220  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0590  hypothetical protein  33.81 
 
 
424 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  31.58 
 
 
422 aa  179  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.526116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  29.11 
 
 
416 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  29.25 
 
 
416 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  29.25 
 
 
416 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  28.71 
 
 
416 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  28.5 
 
 
411 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  26.97 
 
 
419 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.84 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.17 
 
 
416 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.4 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.11 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  24.01 
 
 
423 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.62 
 
 
424 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.11 
 
 
389 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  21.46 
 
 
389 aa  117  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.89 
 
 
413 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.94 
 
 
410 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25 
 
 
414 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 
414 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0384  lipoprotein releasing system transmembrane protein  22.7 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  26.1 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0348  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.47 
 
 
413 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 
375 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  24.28 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.22 
 
 
415 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  26.46 
 
 
405 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.66 
 
 
414 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.09 
 
 
414 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.86 
 
 
421 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1920  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 
470 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.911684  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.45 
 
 
408 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  22.92 
 
 
389 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.99 
 
 
417 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 
385 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  25.72 
 
 
420 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.23 
 
 
411 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.13 
 
 
411 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00597  lipoprotein releasing system transmembrane protein  25 
 
 
416 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.429172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.06 
 
 
415 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.04 
 
 
416 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.27 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1033  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.57 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.25 
 
 
424 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.15 
 
 
417 aa  96.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.63 
 
 
418 aa  96.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  22 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.97 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 
383 aa  94.7  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2836  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.29 
 
 
415 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620052  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  21.88 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.96 
 
 
416 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  24.92 
 
 
417 aa  93.6  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.82 
 
 
414 aa  93.2  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  22.04 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0813  hypothetical protein  24.63 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  22.47 
 
 
409 aa  92  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.62 
 
 
417 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  24.8 
 
 
416 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.27 
 
 
414 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1582  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.78 
 
 
413 aa  90.1  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.346322  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.27 
 
 
416 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.18 
 
 
422 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24 
 
 
416 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1118  hypothetical protein  26.16 
 
 
661 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.55 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.65 
 
 
448 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.55 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  21.69 
 
 
433 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.55 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.55 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.37 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.55 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.92 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.73 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.17 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.55 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.55 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.89 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  23.63 
 
 
408 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  21.69 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2211  hypothetical protein  21.25 
 
 
415 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>