More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0943 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  100 
 
 		 452 aa  920    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3172  hypothetical protein  44.63 
 
 		 471 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.534068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  37.27 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  35.01 
 
 		 443 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3702  hypothetical protein  34.11 
 
 		 449 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.962253  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  33.54 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  32.68 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  28.29 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.25 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  26.08 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 419 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  26.33 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.24 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  26.1 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  27.1 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  27.25 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  27.04 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  27.04 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  27.04 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.35 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  24.84 
 
 		 667 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  27.25 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  24.62 
 
 		 682 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.35 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  25.71 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  27.04 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  24.73 
 
 		 667 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  27.37 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.83 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 		 415 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.21 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 		 383 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  25.99 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25.59 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.11 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  27.15 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.99 
 
 		 642 aa  120  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.26 
 
 		 397 aa  119  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.5 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  25.55 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  27.03 
 
 		 668 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  23.9 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  26.18 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 402 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.95 
 
 		 405 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.94 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  25.11 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  25.66 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  27.55 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.89 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  26.49 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  24.27 
 
 		 663 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  22.62 
 
 		 646 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.22 
 
 		 402 aa  113  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  24.62 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.23 
 
 		 649 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.23 
 
 		 649 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.67 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.33 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.04 
 
 		 648 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  25.11 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  23.87 
 
 		 663 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.04 
 
 		 648 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  21.88 
 
 		 647 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  25.93 
 
 		 657 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.04 
 
 		 648 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.04 
 
 		 648 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  24.18 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.38 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  23.63 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  25.89 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  24.02 
 
 		 650 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  25.7 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  26.5 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  24.72 
 
 		 656 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.7 
 
 		 642 aa  109  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  25.33 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  25.65 
 
 		 651 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  25.44 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  26.02 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  24.78 
 
 		 649 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.67 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  24.26 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  24.26 
 
 		 404 aa  107  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.83 
 
 		 648 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>