More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0200 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
400 aa  805    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  38.13 
 
 
399 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  32.51 
 
 
400 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  26.26 
 
 
403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  27.01 
 
 
403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  27.41 
 
 
395 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  29.31 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0367  efflux ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
403 aa  134  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0625  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis permease  25.68 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0260119  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3893  protein of unknown function DUF214  24.75 
 
 
406 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2015  hypothetical protein  25.13 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0449562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  23.47 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  23.41 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.54 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.68 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.5 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  22.12 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  20.88 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 
848 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.96 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  33.33 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1727  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.25 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.51 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  24.14 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  24.02 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.51 
 
 
389 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  23.06 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  24.47 
 
 
403 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  29.94 
 
 
866 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  23.06 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  22.53 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 
930 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  33.8 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  24.46 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  24.14 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  22.71 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.48 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 
838 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.85 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  22.46 
 
 
401 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  30 
 
 
836 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.57 
 
 
841 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.82 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  21.46 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  33.02 
 
 
821 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.36 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 
429 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.7 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  22.87 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.14 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  29.45 
 
 
373 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2360  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.97 
 
 
411 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.069448  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2475  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.34 
 
 
415 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
852 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.58 
 
 
415 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  22.52 
 
 
409 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  22.09 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.96 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.39 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0590  hypothetical protein  23.48 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
855 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2861  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.55 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.304015  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  24 
 
 
830 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2967  hypothetical protein  23.78 
 
 
381 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  29.28 
 
 
462 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.57 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1602  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.55 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0219168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  25.38 
 
 
408 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  20.56 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  23.65 
 
 
386 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  25.29 
 
 
409 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.04 
 
 
842 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.23 
 
 
882 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25.41 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 
409 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2783  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.81 
 
 
415 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24 
 
 
406 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  26.12 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.02 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1709  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.82 
 
 
415 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.105135  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  22.46 
 
 
401 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  22.46 
 
 
401 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  22.46 
 
 
401 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  25.64 
 
 
861 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  22.46 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.5 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.62 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  22.73 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  22.85 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0187  hypothetical protein  25.07 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  22.46 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>