More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6689 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  930    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  53.99 
 
 
475 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  53.99 
 
 
475 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  53.99 
 
 
475 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  53.99 
 
 
475 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  53.99 
 
 
475 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  53.99 
 
 
475 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  53.99 
 
 
716 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  54.39 
 
 
477 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  57.11 
 
 
475 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  31.59 
 
 
441 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 
436 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  30.79 
 
 
416 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  27.11 
 
 
404 aa  137  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  29.42 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  26.47 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.39 
 
 
400 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  31.43 
 
 
419 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  26.55 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  27.23 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  107  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  26.01 
 
 
422 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.73 
 
 
422 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  26.69 
 
 
409 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  33.33 
 
 
405 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  35.6 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  25.53 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.54 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.37 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  32.12 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.17 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.75 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.92 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.48 
 
 
656 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.48 
 
 
656 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  29.9 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  33.99 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 
830 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  36.3 
 
 
838 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  31.25 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.67 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  30.48 
 
 
647 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  33.57 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  29.41 
 
 
667 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  32.12 
 
 
466 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  33.82 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  29.41 
 
 
682 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  28.09 
 
 
425 aa  66.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  30.28 
 
 
821 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 
457 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  29.41 
 
 
682 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  29.41 
 
 
667 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  31.51 
 
 
467 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  31.4 
 
 
405 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  28.41 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.7 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1376  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.6 
 
 
443 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0730301  normal  0.0697431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  38.06 
 
 
821 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34.39 
 
 
427 aa  64.3  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  34.87 
 
 
662 aa  64.3  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  31.02 
 
 
842 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  23.26 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  25.93 
 
 
649 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  34.27 
 
 
411 aa  63.2  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.61 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
853 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  31.72 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.38 
 
 
409 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  25.71 
 
 
794 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  35.85 
 
 
871 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  28.18 
 
 
452 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  34.17 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  36.6 
 
 
861 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.23 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  34.17 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  24.59 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  26.98 
 
 
647 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  34.36 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  28.38 
 
 
411 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.1 
 
 
426 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0999  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
402 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00052376  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.73 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  22.02 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  31.29 
 
 
855 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  34.03 
 
 
413 aa  61.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.68 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1851  ABC transporter, permease protein, putative  30.6 
 
 
506 aa  60.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00637092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 
422 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  24.22 
 
 
407 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  29.95 
 
 
843 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  34.74 
 
 
420 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  33.12 
 
 
384 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>