More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3659 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 462 aa  923    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  34.62 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  41.53 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.18 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  25.05 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  35.06 
 
 		 381 aa  87.8  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.19 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  29.22 
 
 		 414 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  29.55 
 
 		 397 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  35.17 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  34.01 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  33.58 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  34.78 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.89 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  35.66 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  30.26 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  32.85 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  29.45 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  35.48 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  35.59 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  32.16 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  30.11 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  31.55 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  31.39 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  33.77 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  31.55 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  35.15 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  34.56 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.89 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  33.11 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  32.21 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.82 
 
 		 648 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  32.32 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.34 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  36.03 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  32.62 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  27.22 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  29.41 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  30.15 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  31.13 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.87 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  34.84 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.11 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  30.54 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  38.71 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.03 
 
 		 649 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  38.21 
 
 		 394 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.03 
 
 		 649 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  35 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 848 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  31.25 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.41 
 
 		 644 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  38.02 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  32.88 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  27.27 
 
 		 696 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  28.48 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  28.48 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  37.9 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  36.3 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  30.26 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  37.19 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.82 
 
 		 648 aa  70.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  33.56 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  30 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.82 
 
 		 642 aa  70.9  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  30.46 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.82 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  37.82 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  32.87 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  33.12 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  33.14 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  33.12 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  33.09 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  33.09 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.09 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  28.3 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.09 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  32.12 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  37.4 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.17 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  33.09 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.58 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.33 
 
 		 648 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  30.22 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  32.45 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  32.64 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  35.67 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  35.34 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>