55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2149 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2149  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
831 aa  1696    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
831 aa  296  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1244  hypothetical protein  25.62 
 
 
772 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 
833 aa  120  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  26.3 
 
 
896 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  21.06 
 
 
829 aa  108  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  26.71 
 
 
868 aa  94  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 
775 aa  75.1  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1535  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 
967 aa  73.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.960064  normal  0.0795907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.6 
 
 
853 aa  58.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 
853 aa  56.6  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  22.5 
 
 
856 aa  53.5  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  21.89 
 
 
843 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.1 
 
 
371 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  22.02 
 
 
411 aa  52  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.32 
 
 
387 aa  52  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  21.92 
 
 
846 aa  51.6  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 
861 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0744  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 
811 aa  50.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1977  hypothetical protein  25.25 
 
 
391 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  22.95 
 
 
861 aa  50.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  31.34 
 
 
850 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  27.59 
 
 
396 aa  49.3  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  21.86 
 
 
809 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  34.17 
 
 
410 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  21.77 
 
 
859 aa  49.3  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 
805 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.53 
 
 
854 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  28.68 
 
 
809 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.37 
 
 
848 aa  48.5  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  32.23 
 
 
849 aa  48.5  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.59 
 
 
390 aa  48.5  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  39.74 
 
 
855 aa  48.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  28.89 
 
 
389 aa  47.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  30.87 
 
 
414 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  23.04 
 
 
857 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  27.78 
 
 
397 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  27.78 
 
 
397 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  28.1 
 
 
851 aa  46.2  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
792 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  27.71 
 
 
838 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 
834 aa  45.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  32.23 
 
 
849 aa  45.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  24.37 
 
 
872 aa  45.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.76 
 
 
841 aa  45.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  28.45 
 
 
384 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2042  hypothetical protein  24.43 
 
 
391 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1996  hypothetical protein  24.43 
 
 
391 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.37 
 
 
893 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  23.63 
 
 
387 aa  45.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  20.64 
 
 
847 aa  44.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  23.12 
 
 
808 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  26.72 
 
 
422 aa  44.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.95 
 
 
852 aa  44.3  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 
855 aa  44.3  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>