More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1758 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  100 
 
 		 387 aa  783    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  50.39 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  39.58 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  42.52 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.76 
 
 		 382 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  41.21 
 
 		 385 aa  266  5.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  39.02 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  36.43 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  36.06 
 
 		 385 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  35.11 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  35.55 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  35.75 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  30.69 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  36.76 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  35.76 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  36.18 
 
 		 379 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.9 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  32.9 
 
 		 384 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  32.9 
 
 		 384 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  31.87 
 
 		 384 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  32.9 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  32.13 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  32.13 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  35.19 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  32.21 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  34.14 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.01 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  27.75 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  34.25 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25.3 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  22.99 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1697  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.47 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  25.29 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 		 848 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.96 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  22.03 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.47 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.75 
 
 		 835 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  31.44 
 
 		 647 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.93 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.37 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  26.32 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.1 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  26.13 
 
 		 654 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  26.61 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  28.42 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  26.32 
 
 		 654 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  26.01 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  23.77 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.06 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  32.39 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  31.44 
 
 		 656 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.52 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.84 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  22.65 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.84 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.83 
 
 		 836 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.12 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 838 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  36.61 
 
 		 667 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  36.61 
 
 		 667 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  36.61 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  36.61 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.57 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.5 
 
 		 656 aa  63.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  33.13 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.36 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  28.83 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  23.91 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.68 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  27.43 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  29.09 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3582  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  33.77 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  27.68 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  36.17 
 
 		 400 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  23.91 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.36 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  33.59 
 
 		 647 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.36 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  38.6 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  23.42 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.73 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  28.66 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  22.88 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.82 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  37.27 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.48 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3588  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.36 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  22.36 
 
 		 656 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.94 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  33.12 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.73 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>