46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1977 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1977  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2042  hypothetical protein  98.21 
 
 
391 aa  750    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1996  hypothetical protein  98.21 
 
 
391 aa  750    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2214  hypothetical protein  70.33 
 
 
391 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4129  hypothetical protein  70.6 
 
 
383 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164196  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.29 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.18 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.53 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  33.98 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  23.93 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  27.07 
 
 
430 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
400 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  32.71 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  20.98 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  32.71 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  28.93 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  23.28 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  33.6 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  21.62 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  23.47 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  33.64 
 
 
657 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2149  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 
831 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  26.37 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  35.78 
 
 
413 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.37 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  28.24 
 
 
647 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  35.24 
 
 
666 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 
416 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.9 
 
 
414 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  31.78 
 
 
409 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  34.57 
 
 
657 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  41.43 
 
 
650 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  29.2 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 
413 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 
842 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  28.46 
 
 
656 aa  43.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.46 
 
 
386 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 
405 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31.19 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>