140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2654 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 401 aa  798    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2199  hypothetical protein  38.24 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.748449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  32 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  31.57 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1426  hypothetical protein  33.67 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.407629  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  29 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0985  hypothetical protein  29.38 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  23.33 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  27.11 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.74 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.83 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  25.06 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  23.24 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.21 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.45 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  22.25 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  22.11 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.37 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.97 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1676  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.01 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  22.22 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.61 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  22.61 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  22.25 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.42 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.98 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  21.61 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.27 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.7 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0856  ABC transporter, permease protein, putative  25.24 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0945492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  22.56 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 		 830 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.76 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0777  ABC lipoprotein efflux transporter, inner membrane subunit, LolE  25.59 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1033  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.62 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2433  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.82 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0865492  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  21.99 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0182  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 		 541 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.448122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3477  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.38 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.06 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  22.29 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0774  hypothetical protein  26.82 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.98334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03295  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.64 
 
 		 398 aa  49.7  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  25.36 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  20.14 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  27.78 
 
 		 653 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  22.84 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.02 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1582  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.45 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.346322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1996  hypothetical protein  26.42 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  24.73 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2042  hypothetical protein  26.42 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.28 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.91 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1977  hypothetical protein  26.42 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.37 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  24.59 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  22 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  23.48 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  23.74 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  24.1 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  24.1 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0402  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.94 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.78 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  28.23 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 852 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  26.61 
 
 		 416 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.95 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.34 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2041  lipoprotein releasing system, permease protein, putative  25.08 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.32 
 
 		 422 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2755  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.85 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3421  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.85 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  28.12 
 
 		 805 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.64 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  22.01 
 
 		 388 aa  46.6  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.62 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  22.96 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.3 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.96 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  24.65 
 
 		 657 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.86 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  23.4 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.73 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  27.85 
 
 		 779 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  24.86 
 
 		 787 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.06 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.73 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>