26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2214 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2214  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4129  hypothetical protein  76.96 
 
 
383 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164196  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1977  hypothetical protein  70.33 
 
 
391 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1996  hypothetical protein  70.08 
 
 
391 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2042  hypothetical protein  70.08 
 
 
391 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  22.71 
 
 
387 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.86 
 
 
413 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  30.61 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.46 
 
 
386 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.75 
 
 
648 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  24.1 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 
404 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.71 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  21.56 
 
 
405 aa  43.5  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  24.81 
 
 
401 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.5 
 
 
403 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.93 
 
 
648 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  25.5 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.93 
 
 
648 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.93 
 
 
648 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.93 
 
 
648 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.93 
 
 
648 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3582  protein of unknown function DUF214  32.93 
 
 
410 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>