35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0744 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0744  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
811 aa  1609    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 
833 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  24.44 
 
 
896 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 
838 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  22.15 
 
 
831 aa  61.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  19.62 
 
 
848 aa  55.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 
404 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1535  protein of unknown function DUF214  20.26 
 
 
967 aa  52.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.960064  normal  0.0795907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2149  protein of unknown function DUF214  20.94 
 
 
831 aa  51.6  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 
413 aa  51.2  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  32.19 
 
 
405 aa  50.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  20.68 
 
 
930 aa  48.9  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  20.06 
 
 
841 aa  48.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  20.22 
 
 
842 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  25.9 
 
 
424 aa  47.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.22 
 
 
880 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.51 
 
 
856 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  22.11 
 
 
362 aa  46.6  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  29.5 
 
 
855 aa  46.2  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  22.95 
 
 
773 aa  45.8  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
849 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.12 
 
 
858 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  26.92 
 
 
887 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  22.03 
 
 
779 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2493  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
401 aa  45.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 
852 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  26.92 
 
 
809 aa  45.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.41 
 
 
843 aa  45.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  21.14 
 
 
869 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  23.38 
 
 
406 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
849 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 
414 aa  44.3  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  19.52 
 
 
821 aa  44.3  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.97 
 
 
411 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  20.77 
 
 
836 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>