273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5641 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  100 
 
 
780 aa  1530    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  41.94 
 
 
809 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  43.35 
 
 
809 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  40.73 
 
 
805 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  37.35 
 
 
775 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  35.68 
 
 
779 aa  357  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.16 
 
 
759 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 
852 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  31.42 
 
 
849 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0873  hypothetical protein  25.43 
 
 
756 aa  72  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  31.53 
 
 
850 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  25.89 
 
 
393 aa  61.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  22.47 
 
 
821 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 
847 aa  60.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  28.38 
 
 
414 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  32.64 
 
 
849 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.18 
 
 
397 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 
849 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  28.86 
 
 
427 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 
837 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.63 
 
 
845 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.92 
 
 
858 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  21.84 
 
 
947 aa  58.9  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.97 
 
 
397 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  28.73 
 
 
847 aa  58.5  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 
859 aa  58.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 
848 aa  58.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  29.23 
 
 
394 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24 
 
 
851 aa  57.4  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  21.41 
 
 
1090 aa  57.4  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  25.17 
 
 
425 aa  57.4  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.48 
 
 
842 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.38 
 
 
452 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  33.54 
 
 
407 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
443 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.17 
 
 
854 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 
857 aa  56.6  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  23.55 
 
 
397 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 
378 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26 
 
 
863 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.3 
 
 
843 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 
834 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  30.54 
 
 
853 aa  56.2  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  25.42 
 
 
451 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 
405 aa  55.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.36 
 
 
853 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 
796 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  33.09 
 
 
416 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.59 
 
 
387 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  31.62 
 
 
416 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.06 
 
 
845 aa  55.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  24.65 
 
 
430 aa  54.3  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 
423 aa  53.9  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 
383 aa  53.9  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  29.58 
 
 
410 aa  53.9  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  25.23 
 
 
405 aa  53.9  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.29 
 
 
866 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 
930 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
839 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  25.57 
 
 
425 aa  53.5  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1444  hypothetical protein  28.47 
 
 
778 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.39 
 
 
870 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  23.25 
 
 
403 aa  53.5  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1676  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.17 
 
 
411 aa  53.5  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 
847 aa  53.5  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.17 
 
 
414 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.18 
 
 
857 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.35 
 
 
416 aa  52.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.73 
 
 
417 aa  52.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  29.63 
 
 
433 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  23.08 
 
 
872 aa  52  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  23.94 
 
 
430 aa  52  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  21.04 
 
 
425 aa  51.6  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  30.56 
 
 
453 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 
873 aa  51.6  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
413 aa  51.6  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.63 
 
 
821 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  34.67 
 
 
841 aa  51.2  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.52 
 
 
371 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  25.34 
 
 
861 aa  51.2  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  27.94 
 
 
393 aa  51.2  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  33.07 
 
 
827 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.62 
 
 
424 aa  50.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 
759 aa  50.8  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  30.94 
 
 
415 aa  50.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4691  hypothetical protein  25.4 
 
 
596 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228741  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  29.63 
 
 
414 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.8 
 
 
399 aa  50.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  33.67 
 
 
853 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14710  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  30.43 
 
 
414 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.016176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.68 
 
 
416 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  32.5 
 
 
841 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14690  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  32.35 
 
 
416 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
462 aa  50.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  25.93 
 
 
794 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 
467 aa  49.7  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  35.71 
 
 
419 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25.97 
 
 
414 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.62 
 
 
418 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.97 
 
 
414 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>