38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1444 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  48.7 
 
 		 775 aa  796    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  49.45 
 
 		 735 aa  781    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  49.36 
 
 		 779 aa  815    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  48.72 
 
 		 779 aa  814    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1444  hypothetical protein  100 
 
 		 778 aa  1593    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  49.36 
 
 		 779 aa  805    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  49.23 
 
 		 779 aa  804    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  49.74 
 
 		 779 aa  822    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  49.36 
 
 		 779 aa  805    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3168  protein of unknown function DUF214  42.02 
 
 		 773 aa  629  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  42.31 
 
 		 772 aa  631  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15640  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.23 
 
 		 803 aa  344  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1027  hypothetical protein  20.71 
 
 		 786 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  21.83 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  28.42 
 
 		 452 aa  53.5  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  28.47 
 
 		 780 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 		 457 aa  52  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  35.34 
 
 		 502 aa  50.8  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 779 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  23.43 
 
 		 828 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  27.1 
 
 		 386 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  30.09 
 
 		 794 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  26.78 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.24 
 
 		 403 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 		 796 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  21.65 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.83 
 
 		 419 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  30.09 
 
 		 850 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 		 443 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  30.12 
 
 		 393 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 		 376 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  29.47 
 
 		 466 aa  45.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  31.43 
 
 		 430 aa  45.4  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  30.2 
 
 		 415 aa  45.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 414 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  29.37 
 
 		 414 aa  44.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  30.56 
 
 		 653 aa  44.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 		 857 aa  44.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>