More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23260 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  100 
 
 
419 aa  841    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  56.32 
 
 
419 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.23 
 
 
415 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  27.9 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  27.9 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  29.07 
 
 
412 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.04 
 
 
411 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  26.9 
 
 
407 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  25.81 
 
 
406 aa  123  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  23.67 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  26.45 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  23.92 
 
 
441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  23.95 
 
 
409 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  26.71 
 
 
409 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  25.87 
 
 
411 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  27.2 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 
830 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 
413 aa  109  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  24.19 
 
 
409 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  23.11 
 
 
410 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  26.53 
 
 
425 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  23.32 
 
 
421 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  26.36 
 
 
412 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.07 
 
 
414 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 
404 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  24.2 
 
 
419 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  27.03 
 
 
389 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
535 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.23 
 
 
433 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  23.81 
 
 
435 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  23.42 
 
 
428 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  23.68 
 
 
410 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  26.34 
 
 
389 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2433  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.09 
 
 
428 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0865492  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  23.91 
 
 
411 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.72 
 
 
427 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.07 
 
 
414 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  25.07 
 
 
414 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0777  ABC lipoprotein efflux transporter, inner membrane subunit, LolE  29.09 
 
 
428 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  25.65 
 
 
433 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  25.18 
 
 
404 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.07 
 
 
416 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  25.41 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.78 
 
 
416 aa  99.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.83 
 
 
427 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.81 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.99 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0402  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.62 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  23.62 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.44 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.12 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  22.64 
 
 
441 aa  97.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.46 
 
 
426 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  23.55 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  23.08 
 
 
427 aa  97.1  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.18 
 
 
414 aa  97.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
411 aa  97.1  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.41 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.9 
 
 
434 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.66 
 
 
426 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.29 
 
 
426 aa  96.7  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0787  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.28 
 
 
411 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000127174  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14710  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  25.21 
 
 
414 aa  96.3  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.016176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  23.53 
 
 
416 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3588  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.64 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.38 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.57 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.47 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23.53 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0781  ABC lipoprotein exporter, inner membrane subunit, LolE  24.78 
 
 
411 aa  94  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206341  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.63 
 
 
422 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 
295 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.36 
 
 
416 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.14 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.51 
 
 
426 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.85 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1697  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.7 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  23.46 
 
 
416 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.71 
 
 
413 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.21 
 
 
416 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.35 
 
 
422 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.92 
 
 
416 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.93 
 
 
439 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.04 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  25.68 
 
 
416 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.01 
 
 
416 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  25.23 
 
 
389 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.79 
 
 
408 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.64 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  23.46 
 
 
416 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.01 
 
 
416 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.05 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.71 
 
 
416 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1041  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.81 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  24.59 
 
 
403 aa  90.1  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>