23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3168 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  44.69 
 
 
779 aa  683    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3168  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
773 aa  1553    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  44.63 
 
 
735 aa  658    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  44.92 
 
 
779 aa  688    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  44.68 
 
 
779 aa  694    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  44.69 
 
 
779 aa  683    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  44.2 
 
 
775 aa  676    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  44.69 
 
 
779 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  44.3 
 
 
779 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1444  hypothetical protein  42.02 
 
 
778 aa  624  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  38.19 
 
 
772 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15640  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.9 
 
 
803 aa  278  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1027  hypothetical protein  20.3 
 
 
786 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  30.23 
 
 
429 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  20.39 
 
 
775 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  29.09 
 
 
1177 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.82 
 
 
414 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  22.39 
 
 
407 aa  45.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  26.92 
 
 
488 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
413 aa  45.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28 
 
 
408 aa  44.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 
457 aa  44.7  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  26.13 
 
 
789 aa  44.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>