More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2530 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  815    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  38.05 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  37.89 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.44 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  37.26 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  36.54 
 
 		 422 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  32.55 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  37.84 
 
 		 405 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  36.08 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  36.41 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  32.53 
 
 		 441 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  37.84 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  33.88 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  34 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  31.84 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.79 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  31.27 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  30.79 
 
 		 416 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.56 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.88 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  30.24 
 
 		 716 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  23.69 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.45 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  26.69 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  29.15 
 
 		 465 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  28.74 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  27.51 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  25.6 
 
 		 431 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  24.69 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.51 
 
 		 416 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.51 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  24.61 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.07 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  21.96 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  28.23 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 		 830 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  27.14 
 
 		 475 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  25.17 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  23.21 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.7 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.43 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  21.07 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.21 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  23.99 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.71 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  24.93 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  31.58 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.13 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  27.13 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  24.41 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  20.48 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1620  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.33 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1498  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.14 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00176563  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 		 952 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2008  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.14 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0630458 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  24.2 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2826  protein of unknown function DUF214  28.34 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.43 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  23.8 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01114  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  21.76 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2529  lipoprotein releasing system, transmembrane protein LolE  21.76 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2483  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.76 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00147297  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2205  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.14 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01122  hypothetical protein  21.76 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.76 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00286068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  22.46 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.76 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0067716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.33 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  24.8 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.84 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  21.03 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.51 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.98 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.71 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.21 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.72 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.73 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1851  ABC transporter, permease protein, putative  27.81 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00637092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2475  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.22 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.05 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1242  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>