More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19660 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  100 
 
 
400 aa  805    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  30.79 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  33 
 
 
403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  31.01 
 
 
441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  31.44 
 
 
404 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  30.46 
 
 
416 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  30.02 
 
 
436 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  31.68 
 
 
404 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  30.37 
 
 
422 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  28.04 
 
 
405 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  28.47 
 
 
419 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.07 
 
 
422 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  28.71 
 
 
429 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.11 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 
413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  26.24 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  28.95 
 
 
409 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  28.73 
 
 
405 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  29.5 
 
 
387 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  26.42 
 
 
406 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  25.28 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  25.88 
 
 
425 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  25.6 
 
 
407 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  26.08 
 
 
412 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  28.73 
 
 
405 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  25.62 
 
 
410 aa  106  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
406 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  28.28 
 
 
477 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.58 
 
 
419 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.53 
 
 
419 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
475 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  28.11 
 
 
716 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
475 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
475 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
475 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
475 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
475 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.35 
 
 
415 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  26.3 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  24.09 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.85 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  29.3 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 
830 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  29.05 
 
 
475 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  25.38 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  25.18 
 
 
410 aa  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  23.34 
 
 
441 aa  87  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 
295 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 
459 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  21.46 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  25.07 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  21.5 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  23.78 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  28.64 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  21.17 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 
873 aa  79.7  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  34.97 
 
 
462 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.77 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0496  hypothetical protein  31.22 
 
 
712 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.801522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  23.67 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.17 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  21.63 
 
 
409 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.48 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  28.69 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.98 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  27.63 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.12 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  24.03 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.74 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.36 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  30.61 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 
856 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0424  lipoprotein releasing system, transmembrane protein LolE  21.98 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.7 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.28 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
452 aa  72.8  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  23.31 
 
 
435 aa  72.8  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.42 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.58 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  23.79 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1620  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.61 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356134  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23.83 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.99 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2346  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.86 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003990  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.39 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  31.45 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03295  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.14 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.92 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.08 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>