174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0857 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
459 aa  934    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  28.1 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.65 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3937  hypothetical protein  23.94 
 
 
435 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4079  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4046  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.8 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  21.05 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  21.95 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  22.42 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  25 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  25.09 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  24.21 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  22.67 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 
436 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0497  hypothetical protein  22.67 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  23.79 
 
 
429 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.51 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  23.89 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  21.59 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  22.63 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  21.96 
 
 
407 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  23.28 
 
 
451 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 
295 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 
830 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  24.22 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  22.72 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 
853 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  22.81 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.17 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  25.13 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.17 
 
 
382 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  25.64 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  20.84 
 
 
354 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.08 
 
 
422 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
852 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  23.33 
 
 
847 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  23.25 
 
 
362 aa  54.7  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  20.58 
 
 
354 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  23.51 
 
 
406 aa  54.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  20.58 
 
 
354 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 
792 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  20.58 
 
 
354 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 
379 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  20.58 
 
 
354 aa  53.5  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  28.57 
 
 
379 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  20.57 
 
 
354 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  20.05 
 
 
354 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  20.05 
 
 
354 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  22.71 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 
834 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  21.92 
 
 
806 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  19.74 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  20.63 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  24.6 
 
 
413 aa  50.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  25.93 
 
 
458 aa  50.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 
376 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.12 
 
 
849 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26.09 
 
 
393 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  21.15 
 
 
411 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  23.18 
 
 
427 aa  50.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0922  hypothetical protein  23.82 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.696893 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  26.72 
 
 
829 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.66 
 
 
841 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  21.3 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  24.36 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.36 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  24.7 
 
 
845 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  22.56 
 
 
849 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  34.48 
 
 
787 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 
853 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0496  hypothetical protein  22.84 
 
 
712 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.801522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25 
 
 
854 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  19.79 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  23.99 
 
 
458 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  23.87 
 
 
861 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  21.52 
 
 
849 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 
859 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  18.6 
 
 
422 aa  48.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
467 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  21.97 
 
 
389 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  22.45 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.76 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  23.05 
 
 
871 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 
857 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  25.83 
 
 
425 aa  47.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3857  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.71 
 
 
414 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641909  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  21.49 
 
 
855 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  25.59 
 
 
430 aa  47  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  20.48 
 
 
389 aa  47  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  22.3 
 
 
397 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  21.8 
 
 
397 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
648 aa  46.6  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1317  hypothetical protein  27.94 
 
 
423 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  20.24 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 
848 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>