More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1619 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 382 aa  772    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  43.64 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  38.76 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  39.22 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  39.74 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 		 385 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  37.21 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  40.13 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  35.42 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  34.97 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  37.37 
 
 		 385 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  36.88 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  33.59 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  33.5 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  32.73 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  32.56 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  33.5 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  33.25 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  33.25 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  32.56 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  34.77 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  34.77 
 
 		 384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  34.77 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  33.25 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.94 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 848 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2360  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.05 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.069448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.7 
 
 		 847 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  28.68 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  24.82 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.78 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.81 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  25.55 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 		 852 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  22.93 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  24.76 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  24.69 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 		 846 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  36.44 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.42 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.38 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  24.19 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1545  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.57 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0135691  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.46 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  23.05 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  23.27 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  22.8 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.33 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  23.47 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.33 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.69 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  25.79 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  33.78 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  22.39 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.68 
 
 		 843 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1083  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  31.9 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.11 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  34.92 
 
 		 1090 aa  63.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  23.12 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  23.79 
 
 		 404 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.38 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  22.27 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.63 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2397  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  23.18 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218063  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  23.49 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  28.77 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  27.84 
 
 		 821 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  27.78 
 
 		 885 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25.67 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.38 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1334  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.21 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.414733  normal  0.836705 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.51 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1634  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.13 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0870078  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  27.34 
 
 		 854 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.1 
 
 		 863 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2395  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  21.05 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  26.88 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  24.63 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  20.25 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.03 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  20.38 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  23.99 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  28.67 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.13 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  21.64 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>