More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1622 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
413 aa  805    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  53.23 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  52.09 
 
 
409 aa  351  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  40.1 
 
 
403 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  39.15 
 
 
404 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  38.44 
 
 
404 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  38.24 
 
 
441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 
436 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  28.74 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  34.07 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  32.85 
 
 
422 aa  196  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  32.37 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  30.99 
 
 
419 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  33.49 
 
 
416 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.17 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  30.86 
 
 
406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  31.64 
 
 
387 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  31.64 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 
412 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.45 
 
 
400 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.62 
 
 
419 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.12 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 
441 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  30.28 
 
 
405 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
830 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  31.64 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  29.93 
 
 
407 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.81 
 
 
419 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  27.21 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  29.17 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  30.98 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  34.68 
 
 
475 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  24.13 
 
 
410 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  34.96 
 
 
716 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  34.41 
 
 
477 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
475 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
475 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
475 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
475 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
475 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
475 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  25.78 
 
 
425 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  27.37 
 
 
380 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  25.17 
 
 
431 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.94 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.34 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  25.81 
 
 
389 aa  97.4  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  24.7 
 
 
428 aa  96.7  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  25.42 
 
 
409 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.27 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  23.43 
 
 
411 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  27.5 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.43 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  24.02 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.19 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.79 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.36 
 
 
423 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.47 
 
 
422 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  28.25 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.47 
 
 
422 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25 
 
 
389 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25.73 
 
 
414 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.73 
 
 
414 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  23.56 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 
414 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.84 
 
 
408 aa  87  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.18 
 
 
416 aa  86.7  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  31.33 
 
 
400 aa  87  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.73 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.07 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  27.98 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.01 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.82 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.34 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  31.33 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.27 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.75 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.74 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.34 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  26.15 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.16 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  22.66 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01532  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.54 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.72 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  22.78 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  22.85 
 
 
416 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.6 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.78 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  28.14 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  37.9 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.69 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.62 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.55 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.88 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2755  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.53 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.4 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3421  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.53 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>