More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A3143 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  99.58 
 
 		 475 aa  947    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  99.79 
 
 		 716 aa  953    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  89.73 
 
 		 477 aa  812    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  99.58 
 
 		 475 aa  947    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  99.37 
 
 		 475 aa  945    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  99.58 
 
 		 475 aa  947    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  99.58 
 
 		 475 aa  947    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 475 aa  950    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  73.05 
 
 		 475 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  55.46 
 
 		 465 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  31.57 
 
 		 441 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  27.06 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  29.68 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  23.8 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  25.83 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  24.48 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.9 
 
 		 400 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  25.62 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  27.24 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  27.82 
 
 		 409 aa  90.5  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  24.95 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  28.51 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  29.88 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  34.82 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 404 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.25 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.2 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  28.97 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.75 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.89 
 
 		 842 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.84 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  27.54 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.19 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.79 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.85 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.91 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.51 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  30.93 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  24.14 
 
 		 425 aa  67  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  36 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.8 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  26.55 
 
 		 424 aa  66.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.67 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.27 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.74 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 		 838 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.47 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  31.65 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1118  hypothetical protein  29.41 
 
 		 661 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.41 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  31.65 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  31.07 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.24 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.48 
 
 		 843 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.7 
 
 		 648 aa  64.7  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.88 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.23 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.52 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  31.51 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  35.33 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.1 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.4 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.13 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  25.69 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  25.79 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  24.76 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  24.76 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.32 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  35.33 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  25.69 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  25.69 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0778  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  28.57 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.526116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  25.69 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4145  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.78 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  25.97 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  35.33 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.89 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.89 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.74 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  32.68 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.2 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  34.67 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  27.64 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.5 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>