More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2344 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  89.31 
 
 
475 aa  816    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  89.52 
 
 
716 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  89.31 
 
 
475 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
477 aa  957    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  89.1 
 
 
475 aa  815    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  89.73 
 
 
475 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  89.31 
 
 
475 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  89.31 
 
 
475 aa  816    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  72.08 
 
 
475 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  55.23 
 
 
465 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  30.59 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  28.63 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 
436 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  23.92 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  24.53 
 
 
406 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.67 
 
 
400 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  24.01 
 
 
407 aa  104  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  25.21 
 
 
404 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  27.64 
 
 
419 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 
404 aa  90.5  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  26.93 
 
 
409 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  24.95 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  28.11 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  28.11 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  34.41 
 
 
413 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.01 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.62 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  28.33 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.51 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.05 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.29 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.18 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.95 
 
 
842 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.68 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.29 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.29 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  28.74 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.29 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.91 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.06 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.13 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.69 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.91 
 
 
420 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
422 aa  69.7  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4145  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.89 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  30.53 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.56 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  35.53 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  35.53 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.23 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.42 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.24 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  36 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  28.86 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1118  hypothetical protein  29.41 
 
 
661 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279794 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  36 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  26.02 
 
 
416 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.77 
 
 
439 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.77 
 
 
439 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  24.76 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  24.76 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.11 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.81 
 
 
843 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.47 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 
838 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  37.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.77 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  36.18 
 
 
397 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 
413 aa  63.9  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4462  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.38 
 
 
447 aa  63.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.23 
 
 
421 aa  63.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 
424 aa  63.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  28.51 
 
 
384 aa  63.5  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.06 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  35.53 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
848 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.1 
 
 
417 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  38.21 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.86 
 
 
424 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  27.89 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.526116 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  30.61 
 
 
424 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.97 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.5 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23.97 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  26.1 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  32.74 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.69 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 
406 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  29.44 
 
 
409 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.47 
 
 
411 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30.87 
 
 
443 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  28.14 
 
 
409 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  22.46 
 
 
401 aa  61.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 
466 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  24.81 
 
 
422 aa  60.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  27.23 
 
 
425 aa  60.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  35.57 
 
 
461 aa  60.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>