More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0369 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  802    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  60.2 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  53.75 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  37.16 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  38.85 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  34 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.84 
 
 		 400 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  29.48 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  30.27 
 
 		 422 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  28.95 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.43 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  27.27 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  29.52 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.83 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  29.71 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  29.59 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  29.64 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  27.59 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.28 
 
 		 411 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.43 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  27.23 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  26.6 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  23.79 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  26.03 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  25.94 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  24.86 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 830 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  24.1 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  23.91 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 535 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  25.71 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.56 
 
 		 411 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  25.3 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.65 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.59 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  30.83 
 
 		 475 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  28.86 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  22.86 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  27.64 
 
 		 716 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  27.16 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  21.45 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.39 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  23 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.35 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.62 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  24.26 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.67 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2205  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.65 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.28 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  24.2 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0078  hypothetical protein  22.14 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.14 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2529  lipoprotein releasing system, transmembrane protein LolE  26.24 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.24 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0067716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.24 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00286068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2483  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.24 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00147297  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  25.6 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2008  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.24 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0630458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1498  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.24 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00176563  normal  0.978701 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01114  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  25.86 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  26.72 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01122  hypothetical protein  25.86 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  26.43 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003990  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  26.04 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.67 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.37 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.44 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.89 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.62 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.57 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.99 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.32 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.66 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0127  LolC/E family lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.36 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  33.61 
 
 		 870 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 		 847 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.73 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.01 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2003  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.79 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0260565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 		 853 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.28 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  21.71 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 		 838 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>